求助,序列提交genbank序列格式问题

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关于序列的提交,除了你前面提到嘚还有基于WWW方式的方法: 叫BankIt,直接点他进入,填写相关信息,STEP BY STEP,即可.

序列的提交 genbank序列格式 序列提交要求 向genbank序列格式提交的序列应该是由提交者确定和注释的新序列 来源于或用于构建非genbank序列格式 的第三方数据库的数据也可能用Bankit提交。 以下幾种情形不允许提交到数据库 genbank序列格式序列提交需要的条件 通过登录系统注册MyNCBI 序列可以通过复制粘贴或文本形式上传(多条序列必须是FASTA格式) 提交序列公布的期限(是立即公布还是指定特定日期) 序列提交者、文章作者、题名等相应的参考文献等基本信息 序列来源物种名稱等描述信息 序列特征(例如CDS,generRNA,tRNA内含子,产物名称等) * /WebSub/?tool=genbank序列格式 序列长度小于200bp除非它是完整的外显子、非编码RNA (ncRNA)、微卫星或古DNA。 人工拼接的不连续的序列:例如拼接了多个外显子而没有内含子序 列或者内含子区域有误。 仅有引物序列 仅有蛋白质序列 单条序列标紸多种分子类型例如即标注为基因组序列,又标注为mRNA序列 表达序列标签(EST)ESTs应当通过dbEST系统进行提交。 基因组勘测序列(GSS)GSSs应当通过dbGSS系统提交。 序列标签位点(STS)STSs应当通过dbSTSA系统提交。 依次填入:名、姓、部门、机构、街道地址、城市、省份、邮编、国家、电话、传真、电子邮箱信息点击继续 continue 参考文献信息:填写序列提交者姓名、文章题名、发表状态等 在该页面中,可以指定序列信息公布时间、说明序列是否为16S rRNA序列分子类型、拓扑结构、基因组信息完整性。分子类型分为基因组DNA由cDNA到mRNA,基因组RNARNA前体,转运RNA非编码RNA,小胞浆RNAcRNA,其怹RNA和其他DNA 拓扑结构为线性或环形。 点击Continue后会跳出一个确认窗口如果信息准确无误,则可以点继续如果部分信息有误,则会指出错误位置 选择提交数据类型:Original 是由提交者直接提交,Third Party Annotation 是从其它数据库中第三方进行注释的序列 测序技术的选择 传统的桑格的双脱氧测序方法,一般单条短序列测定都采用此方法 罗氏公司的高通量测序平台 ABI公司的高通量测序平台 线粒体 线粒体:动质体 质体:叶绿体、apicoplast(原生動物质体样细胞器)、有色体、蓝色小体、白体、原生质体、核形体。 前病毒 染色体外的大核 检查输入信息无误后,点继续 *

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