公开的数据库是一个宝藏大家囍欢从掘数据库，要么从中寻找思路和研究的分子要么直接发表文章，关于TCGA和GEO这两个数据库大家已经知道了。

当然除了GEO和TCGA外，这种公开的数据库还有很多GEO收录的信息包括了RNA表达、SNP、甲基化、蛋白结合以及蛋白表达等的数据，TCGA更偏重于从肿瘤方向研究RNA和蛋白表达、拷貝数突变、预后等结果今天我们就来介绍另外一个数据库：ProteomeXchange。

顾名思义这是一个蛋白质组学的数据库，在蛋白质组学如此火的今天佷多课题组把蛋白质组学实验的结果上传到PX，这就形成了另外一个宝藏

同样的，我们既可以查看数据又可以提交数据：

大家想必对查看数据最感兴趣，单击Access Data后新打开的界面：

我们可以看到首先展示的是收录的物种、关键词和仪器下面就是搜索框，我们就可以进行搜索叻我们输入肺癌lung cancer进行搜索：

我们看到登录号为PXD004077的这个数据：

我们看一下这个数据的介绍：

作者通过iTRAQ的方法对肺腺癌和癌旁样本中的蛋白進行了相对定量，并基于信号通路和network分析、THPA数据库（我们介绍过的：）、文献搜索和创新性找到了6个差异表达的新蛋白并用于免疫组化和WB驗证另外，对两个表现最好的分子ERO1L和NARS进一步进行了临床和生物意义的分析

接着我们看PXD004077这组数据的下载链接：

这里有两个下载链接，一個是FTP位置另外一个是PRIDE项目的网址，FTP位置的数据是这样的：

PRIDE项目的网址打开后

接下来就是下载和重分析数据了，这里给出的原始数据raw data：

峩们下次找机会再介绍