病毒的生物信息学分析有哪些

马铃薯卷叶病毒的RT-PCR检测和生物信息学分析
本实验对陕西榆林疑似感染马铃薯卷叶病毒(Potato leaf roll virus , PLRV) 的病株毒源进行分子生物学鉴定,在分子水平上证实了陕西存在PLRV然后以获得的目标基洇序列为基础,应用生物信息学方法对其结构、特性和功能进行了分析预测为进一步研究其结构功能、探索抗病途径奠定了基础。
PLRV)在铨世界马铃薯种植区广泛发生每年造成巨大的农林经济损失。本实验对陕西榆林疑似感染PLRV的马铃薯植株的总RNA进行分离提取接着利用RT-PCR手段扩增了陕西PLRV?CP基因,然后进行测序结果显示该CP基因的核苷酸序列和CP氨基酸序列与已报道的PLRV?CP高度同源,在分子水平上证实了陕西存在PLRV然后以上述获得的PLRV?CP序列为基础,应用生物信息学方法对其结构、特性和功能进行了分析预测为进一步研究其结构功能、探索抗病途徑奠定了基础。

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