线粒体基因组注释上 a t含量为什么不一样

引用本文 0
黄族豪, 杨承忠 . 动物线粒体基因组GC含量分析[J] 四川动物, ): 107-110.
HUANG Zuhao, YANG Chengzhong . Analysis of GC Contents in Animal Mitogenome[J] Sichuan Journal of Zoology, ): 107-110.
动物线粒体基因组GC含量分析
杨承忠2* &&&&
1. 井冈山大学生命科学学院, 江西吉安343009;
2. 重庆师范大学生命科学学院, 重庆市动物生物学重点实验室, 重庆 401331
基金项目:国家自然科学基金项目(60088);江西省自然科学基金项目(20132BAB204022);江西省教育厅科技项目(GJJ11529), 赣鄱英才555人才工程; 江西省主要学科学术和技术带头人培养计划(20133BCB22010)
通信作者:杨承忠,E-mail:
摘要:碱基组成是指基因组中腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶的相对含量,一般用鸟嘌呤和胞嘧啶的含量(GC含量)表示。前人的研究表明,不同类群的核基因组GC含量存在差异, 然而,对于动物线粒体基因组碱基组成的研究却很少。为此,本文统计和分析了分属于20个门的609个动物线粒体基因组的碱基组成。结果表明,各门动物间线粒体基因组GC含量没有显著差异,不能反映各动物门间的进化关系。脊椎动物鱼纲、两栖纲、爬行纲、鸟纲和哺乳纲及其代表性目的线粒体基因组GC含量虽有一定差异,但并未发现明显的变化规律。
动物线粒体基因组&&&&
碱基组成&&&&
Analysis of GC Contents in Animal Mitogenome
HUANG Zuhao1, YANG Chengzhong2* &&&&
1. School of Life Sciences, Jinggangshan University, Ji'an, Jiangxi Province 343009, China;2. Chongqing Key Laboratory of Animal Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University, Chongqing 401331, China
Abstract:Base composition refers to the relative content of adenine, guanine, cytosine, and thymine within a genome, which is commonly represented by GC contents. Many previous studies demonstrated that the base compositions of nuclear genome as well as its features were variable in different phyla. However, few studies were concerned on the GC contents in animal mitochondrial genome. Hence, base compositions of 609 mitochondrial genomes belonged to 20 phyla were analyzed in this paper. The results indicated that the GC contents of mitochondrial genomes in animal phyla had no significant difference and could not reflect the evolutionary relationships among them. Certain differences on GC contents were observed in the vertebrates (Pisces, Amphibia, Reptile, Aves and Mammalia), but no significant rules were found.
Key words:
animal mitochondrial genome&&&&
base composition&&&&
variation&&&&
碱基组成是指基因组中腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)的相对含量。碱基组成在全基因组尺度上一般用GC含量(GC content)表示。在核基因组中,碱基组成是一个变化很大的参数,基因组的差异首先通过碱基组成的变化表现出来。基因组的碱基组成具有种的特异性,但没有组织和器官的特异性(;)。生长发育阶段和营养状态不会影响基因组的碱基组成。
随着PCR(polymerase chain reaction)技术的出现()以及DNA测序技术的不断发展和完善(;),人们可以获得各类物种的DNA序列,为对比分析基因组的碱基组成变化特征提供了方便(;)。证明每个核基因组都有自己的碱基组成特征,从而提出了基因组假说(genome hypothesis)。后来出现了各种用于核基因组碱基组成研究的方法,如语言学的方法等()。很多生物类群的碱基组成也得到了研究(;)。
GC相对于AT的丰度是区分细菌基因组的特征之一,不同的原核生物GC含量的变化非常大(;)。真核生物核基因组的GC含量差别没有原核生物的那么大,但其GC含量在真核基因识别中也起着非常重要的作用(;),特别是脊椎动物和植物核基因组等值区在物种适应和进化中的研究取得了重要进展(;;;;;;)。对于基因组GC含量变化差异的原因,学者们做了很多工作,如对鸟类、节肢动物、细菌等的分析,研究发现在一些无脊椎动物中,碱基组成存在种的差异(,;;;;;;;;Necsulea & ;;)。黄族豪等: 动物线粒体基因组GC含量分析
前人对动物核基因组碱基组成相关的研究较多,而对于动物线粒体基因组碱基组成的研究却很少()。动物线粒体基因组由于其特殊的遗传方式和组织结构,其碱基组成的规律可能与核基因组不同。为此,本文对不同类群的动物线粒体基因组的碱基组成进行了统计分析,以期为动物基因组遗传和进化模式的深入研究积累基础资料。1 研究方法1.1 动物线粒体基因组序列
动物线粒体基因组序列在NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/)网站下载。共下载了609个线粒体基因组序列。基因组均以FASTA文件格式保存。1.2 数据分析
对FASTA格式保存的线粒体基因组,用我们编写的python脚本计算每个线粒体基因组的GC含量。利用SPSS 16.0软件对不同类群GC含量进行整理分析。用Kruskal-Wallis test和Steel-Dwass test对不同分类阶元的线粒体基因组GC含量进行差异性比较。2 结果
对609个动物线粒体基因组统计分析表明,平均GC含量为33.7%,最低的为13%,最高的为49%,变化无明显规律。对各动物门的线粒体基因组GC含量的统计结果表明,含量最低的类群是栉水母动物门Ctenophora(20%),最高的为扁盘动物门Placozoa(42%)和半索动物门Hemichordata(42%)(图 1)。动物类群从低等到高等,其碱基含量并未呈现明显的规律性变化(图 1)。
图 1 线粒体基因组GC含量在各动物门间的变化
Fig. 1 The GC contents in mitogenomes of 20 Phyla
a. 原生动物门,b. 多孔动物门,c. 扁盘动物门,d. 腔肠动物门,e. 栉水母动物门,f. 扁形动物门,g. 棘头动物门,h. 线虫动物门,i. 轮虫动物门,j. 环节动物门,k. 星虫动物门,l. 软体动物门,m. 节肢动物门,n. 苔藓动物门,o. 腕足动物门,p. 箒虫动物门,q. 棘皮动物门,r. 毛颚动物门,s. 半索动物门,t. 脊索动物门
a. Protozoa,b. Porifera,c. Placozoa,d. Coelenterata,e. Ctenophora,f. Platyhelminthes,g. Acanthocephala,h. Nematoda,i. Rotifera,j. Annelida,k. Sipuuculoidea,l. Mollusca,m. Arthropoda,n. Bryozoa,o. Brachiopoda,p. Phoronida,q. Echinodermata,r. Chaetognatha,s. Hemichordata,t. Chordata
对脊椎动物鱼纲Pisces、两栖纲Amphibia、爬行纲Reptile、鸟纲Aves和哺乳纲Mammalia这5个类群的GC含量进行比对分析。结果表明:GC含量在鱼纲与鸟纲之间差异无统计学意义(P>0.05),在爬行纲和哺乳纲之间差异无统计学意义(P>0.05),除此之外各类群两两之间差异都有统计学意义(P<0.05)(图 2)。
图 2 线粒体基因组GC含量在脊椎动物各类群间的变化
Fig. 2 The GC contents in mitogenomes of Vertebrata
YG. 鱼纲,LQG. 两栖纲,PXG. 爬行纲,NG. 鸟纲,BRG. 哺乳纲; u-w.表示相同字母间差异无统计学意义,不同字母间差异有统计学意义。
YG. Pisces,LQG. Amphibia,PXG. Reptile,NG. Aves,BRG. M u-w. different letlers indicate significant difference in GC contents(P<0.05).
我们进一步对鱼纲、两栖纲、爬行纲、鸟纲和哺乳纲的下级分类阶元进行了比较分析。其中,鱼纲抽选了鲈形目Perciformes、鲤形目Cypriniformes、鲟形目Acipenseriformes和鲀形目Tetraodontiformes;两栖纲抽选了无尾目Anura和有尾目Caudata;爬行纲抽选了龟鳖目Testudines和有鳞目Squamata;鸟纲抽选了雀形目Passeriformes、鸡形目Galliformes、雁形目Anseriformes和鹤形目Gruiformes;哺乳纲抽选了灵长目Primates、食肉目Carnivora、鲸偶蹄目Cetartiodactyla和翼手目Chiroptera。结果表明,鱼纲抽选的4个目之间差异均无统计学意义(P>0.05);两栖纲抽选的2个目之间差异有高度统计学意义(P<0.01);爬行纲抽选的2个目之间差异有高度统计学意义(P<0.01);鸟纲的4个目中,雁形目与所有其他3个目差异有统计学意义(P<0.05),除此外,各目间差异均无统计学意义(P>0.05);哺乳纲抽选的4个目中,除了灵长目与偶蹄目之间差异有统计学意义(P<0.05)外,其余各目之间差异均无统计学意义(P>0.05)。3 讨论
从各动物线粒体基因组GC含量之间的差异性来看,动物线粒体基因组GC含量整体上并不能反映类群特征和进化关系,无论纲、门还是目的水平,各类群线粒体基因组GC含量的变化并无明显规律。这可能与动物线粒体基因组本身的结构特征有关:各基因间排列紧凑,很少有基因间隔区域;蛋白质编码基因的总长度占了线粒体基因组的70%左右;控制区是整个线粒体基因组中变异度最高的一个区域,但其长度所占的比例却很低。而核基因组却不同,核基因组中存在着大量的非编码区域,这些区域的变异增加了核基因组碱基组成上的较大差异,而这些差异可能与动物类群或动物进化历史有着紧密的联系。与之相比,动物线粒体基因组的碱基组成差异却要小得多,这种较小的差异主要是由碱基替换造成,而核基因组碱基差异的来源却要广泛得多。一些学者研究了脊椎动物核基因组大小与GC含量的关系(如;;)。通过研究154种脊椎动物发现,GC含量与基因组大小呈显著性正相关。尤其是,小基因组中的GC含量变化更大,但大基因组中的基本稳定在46%左右。一个可能的原因是大基因组更容易突变,而GC碱基对的高稳定性有利于大基因组()。然而,本研究中,动物线粒体基因组含量最低的类群是栉水母动物门(20%),最高的为扁盘动物门和半索动物门(42%)(图 1)。栉水母动物门线粒体基因组长度范围为10 326~11 016 bp,扁盘动物门和半索动物门线粒体基因组长度范围分别为32 661~43 079 bp和15 708~17 037 bp。在所有这些类群中,扁盘动物门线粒体基因组最长,而线粒体长度最短的却不是栉水母动物门,而是原生动物门( bp)。比较这20个类群中线粒体基因组大小和线粒体基因组GC含量的关系发现,动物线粒体基因组GC含量的高低与线粒体基因组大小并无必然联系。这表明动物线粒体基因组的变化规律并不符合所发现的GC含量与基因组大小呈显著性正相关的规律。虽然动物线粒体基因组的碱基组成含量的变化在类群或进化上无明显规律,但动物线粒体基因组具有环形结构、基因排列紧凑、几乎不发生重组和典型的母系遗传等特征(),使其在物种分类、系统发生和遗传多样性方面的应用很广泛(;;;,;)。
致谢: 感谢重庆师范大学赵元莙教授和四川大学杜联明博士在本研究中给予的帮助!
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分子生物学习题集精解(已解密)
生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?第二章?一、填空题?DNA?与染色体1.病毒ΦX174 及?M13 的遗传物质都是 单链?DNA? 。? 2.AIDS 病毒的遗传物质是 单链?RNA? 。?3.X
射线分析证明一个完整的?DNA 螺旋延伸长度为? 3.4nm? 。? 4. 氢 键负责维持?A?T 间(或?G?C 间)的亲和力? B? 型螺旋。5.天然存在的?DNA 分子形式为右手?二、选择题(单选或多选)? 1.证明?DNA?是遗传物质的两个关键性实验是:肺炎球菌在老鼠体内的毒性和?T2?噬菌体感染大肠 杆菌。这两个实验中主要的论点证据是(? C? ) 。? A.从被感染的生物体内重新分离得到?DNA 作为疾病的致病剂? B.DNA 突变导致毒性丧失? C.生物体吸收的外源?DNA(而并非蛋白质)改变了其遗传潜能? D.DNA 是不能在生物体间转移的,因此它一定是一种非常保守的分子? E.真核心生物、原核生物、病毒的?DNA 能相互混合并彼此替代? 2.1953 年?Watson 和?Crick 提出(? A? ) 。? A.多核苷酸?DNA 链通过氢键连接成一个双螺旋? B.DNA 的复制是半保留的,常常形成亲本?子代双螺旋杂合链? C.三个连续的核苷酸代表一个遗传密码? D.遗传物质通常是?DNA 而非?RNA? E.分离到回复突变体证明这一突变并非是一个缺失突变? 3.DNA?双螺旋的解链或变性打断了互补碱基间的氢键,并因此改变了它们的光吸收特性。以下哪 些是对?DNA 的解链温度的正确描述?(? C、D? )?A.哺乳动物?DNA 约为?45℃,因此发烧时体温高于 42℃是十分危险的? B.依赖于?A?T 含量,因为?A?T 含量越高则双链分开所需要的能量越少? C.是双链?DNA 中两条单链分开过程中温度变化范围的中间值? D.可通过碱基在?260nm 的特征吸收峰的改变来确定? E.就是单链发生断裂(磷酸二酯键断裂)时的温度生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?1?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?4.DNA 的变性(? A、C、E? ) 。? A.包括双螺旋的解链? C.是可逆的? E.包括氢键的断裂? B.可以由低温产生? D.是磷酸二酯键的断裂?5.在类似?RNA 这样的单链核酸所表现出的“二级结构”中,发夹结构的形成(? A、D? ) 。? A.基于各个片段间的互补,形成反向平行双螺旋? B.依赖于?A?U 含量,因为形成的氢键越少则发生碱基配对所需的能量也越少? C.仅仅当两配对区段中所有的碱基均互补时才会发生? D.同样包括有像?G?U 这样的不规则碱基配对? E.允许存在几个只有提供过量的自由能才能形成碱基对的碱基? 6.DNA 分子中的超螺旋(? A、C、E? ) 。? A.仅发生于环状?DNA 中。如果双螺旋在围绕其自身的轴缠绕后(即增加缠绕数)才闭合,则双螺 旋在扭转力的作用下,处于静止? B.在线性和环状?DNA 中均有发生。缠绕数的增加可被碱基配对的改变和氢键的增加所抑制? C. 可在一个闭合的?DNA 分子中形成一个左手双螺旋。 负超螺旋是?DNA 修饰的前提, 为酶接触?DNA? 提供了条件? D.是真核生物?DNA 有比分裂过程中固缩的原因? E.是双螺旋中一条链绕另一条链的旋转数和双螺旋轴的回转数的总和? 7.DNA 在?10nm 纤丝中压缩多少倍? (? A? )? A.6 倍? B.10 倍? C.40 倍? D.240 倍? E.1000 倍? F.10000 倍?8.下列哪一条适用于同源染色单体?(? D? )? A.有共同的着丝粒? C.有丝分列后期彼此分开? D.两者都按照同样的顺序,分布着相同的基因,但可具有不同的等位基因? E.以上描述中,有不止一种特性适用同源染色单体? 9.? DNA 在?30nm 纤丝中压缩多少倍?(? C? )? A.6 倍? B.10 倍? C.40 倍? D.240 倍? E.1000 倍? F.10000 倍? B.遗传一致性?10.DNA 在染色体的常染色质区压缩多少倍?(? E? )生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?2?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.6 倍?B.10 倍?C.40 倍?D.240 倍?E.1000 倍?F.10000 倍?11.DNA 在中期染色体中压缩多少倍? (? F? )? A.6 倍? B.10 倍? C.40 倍? D.240 倍? E.1000 倍? F.10000 倍?12.分裂间期的早期,DNA 处于(? A? A.单体连续的线性双螺旋分子? C.保留复制的双螺旋结构? E.以上都不正确? 13.分裂间期?S 期,DNA 处于(? B? A.单体连续的线性双螺旋分子? C.保留复制的双螺旋结构? E.以上都不正确?)状态。? B.半保留复制的双螺旋结构? D.单链?DNA?)状态。? B.半保留复制的双螺旋结构? D.单链?DNA?14.当一个基因具有活性时(? A、C? ) 。? A.启动子一般是不带有核小体的? B.整个基因一般是不带有核小体的?C.基因被核小体遮盖,但染色质结构已发生改变以至于整个基因对核酸酶降解更加敏感三、判断题? 1.在高盐和低温条件下由?DNA 单链杂交形成的双螺旋表现出几乎完全的互补性,这一过程可看作 是一个复性(退火)反应。 (错误)? 2.单个核苷酸通过磷酸二酯键连接到?DNA 骨架上。(正确)? 3.DNA 分子整体都具有强的负电性,因此没有极性。 (错误)? 4.在核酸双螺旋(如? DNA)中形成发夹环结构的频率比单链分子低。发夹结构的产生需要回文序 列使双链形成对称的发夹,呈十字结构。(正确)? 5. 病毒的遗传因子可包括?1?300 个基因。 与生命有机体不同, 病毒的遗传因子可能是?DNA 或?RNA, (但不可能同时兼有! )因此?DNA 不是完全通用的遗传物质。(正确)?100? 6.一段长度?100bp?的?DNA,具有?4? 种可能的序列组合形式。(正确)?7.C0t1/2?与基因组大小相关。(正确)? 8.C0t1/2?与基因组复杂性相关。(正确)? 9.非组蛋白染色体蛋白负责?30nm 纤丝高度有序的压缩。(正确)? 10. 因为组蛋白?H4 在所有物种中都是一样的, 可以预期该蛋白质基因在不同物种中也是一样的。 错 ( 误) (不同物种组蛋白?H4 基因的核苷酸序列变化很大, )生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?3?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?四、简答题? 1.碱基对间在生化和信息方面有什么区别? 答: 从化学角度看,不同的核苷酸仅是含氮碱基的差别。 从信息方面看,储存在?DNA 中的信息是指碱基的顺序,而碱基不参与核苷酸之间的共价连接, 因此储存在?DNA 的信息不会影响分子结构,来自突变或重组的信息改变也不会破坏分子。? 2.在何种情况下有可能预测某一给定的核苷酸链中“G”的百分含量? 答: 由于在? DNA?分子中互补碱基的含量相同的,因此只有在双链中? G+C?的百分比可知时,G%=? (G+C)%/2? 3.真核基因组的哪些参数影响?C0t1/2?值? 答:? C0t1/2?值受基因组大小和基因组中重复?DNA 的类型和总数影响。? 4.哪些条件可促使?DNA 复性(退火)? 答: 降低温度、pH 和增加盐浓度。? 5.为什么?DNA 双螺旋中维持特定的沟很重要? 答: 形成沟状结构是?DNA 与蛋白质相互作用所必需。?9? 6.大肠杆菌染色体的分子质量大约是?2.5×10? Da,核苷酸的平均分子质量是?330Da,两个邻近核苷酸对之间的距离是?0.34nm,双螺旋每一转的高度(即螺距)是?3.4nm,请问: (1)该分子有多长? 答:1 碱基=330Da,1 碱基对=660Da?9? 6? 碱基对=2.5×10? /660=3.8×10? kb? 6? 6? 染色体?DNA 的长度=3.8×10? /0.34=1.3×10? nm=1.3mm?(2)该?DNA 有多少转?6? 5? 答:转数=3.8×10? ×0.34/3.4=3.8×10?7. 曾经有一段时间认为,? DNA 无论来源如何, 都是?4 个核苷酸的规则重复排列 (如?ATCG、? ATCG、? ATCG、ATCG…) ,所以? DNA? 缺乏作为遗传物质的特异性。第一个直接推翻该四核苷酸定理的证 据是什么? 答:生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 4? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?在? 年间,E?Chargaff 发现: (1)不同来源的?DNA 的碱基组成变化极大 (2)A 和?T、C 和?G 的总量几乎是相等的(即?Chargaff 规则) (3)虽然(A+G)/(C+T)=1,但(A+T)/(G+C)的比值在各种生物之间变化极大? 8.为什么在?DNA 中通常只发现?A?T 和?C?G 碱基配对? 答: (1)C?A? 配对过于庞大而不能存在于双螺旋中;G?T? 碱基对太小,核苷酸间的空间空隙太大无法 形成氢键。 (2)A 和?T 通常形成两个氢键,而?C 和?G 可形成三个氢键。正常情况下,可形成两个氢键的碱基 不与可形成三个氢键的碱基配对。? 9.列出最先证实是?DNA(或?RNA)而不是蛋白质是遗传物质的一些证据。? 10.为什么只有?DNA 适合作为遗传物质? 答:是磷酸二酯键连接的简单核苷酸多聚体,其双链结构保证了依赖于模板合成的准确性,DNA 的 以遗传密码的形式编码多肽和蛋白质,其编码形式多样而复杂生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?5?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?第三章一、填空题?基因与基因组结构1.在许多人肿瘤细胞内, 端粒酶 基因的异常活化似乎与细胞的无限分裂能力有关。? 2.包装为核小体可将裸露?DNA 压缩的? 7? 倍。? 3.哺乳动物及其他一些高等动物的端粒含有同一重复序列,即? 4.细胞主要在 分裂间期 表达基因,此时染色体结构松散。? 5.在所有细胞中都维持异染色质状态的染色体区,称为 组成型 异染色质。? 6.在分裂间期呈现着色较深的异染色质状态的失活 X 染色体,也叫作 巴氏小体 。? 7.果蝇唾液腺内的巨大染色体叫作 多线染色体 ,由众多同样的染色质平行排列而成。? TTAGGG? 。?8.一般说来,哺乳动物线粒体与高等植物叶绿体的基因组相比, 叶绿体 更大些。? 9.原生动物四膜虫的单个线粒体称作 二、选择题(单选或多选)? 1.多态性(可通过表型或?DNA 分析检测到)是指(? C? ) 。? 动粒 。A.在一个单克隆的纯化菌落培养物中存在不同的等位基因? B.一个物种种群中存在至少?2 个不同的等位基因? C.一个物种种群中存在至少?3 个不同的等位基因? D.一个物基因影响了一种表型的两个或更多相关方面的情况? E.一个细胞含有的两套以上的单倍体等位基因? 2.真核基因经常被断开(? B、D、E? ) 。? A.反映了真核生物的?mRNA 是多顺反子? B.因为编码序列外显子被非编码序列内含子所分隔? C.因为真核生物的? DNA? 为线性而且被分开在各个染色体上,所以同一个基因的不 同部分可能分布于不同的染色体上? D.表明初始转录产物必须被加工后才可被翻译? E. 表明真核基因可能有多种表达产物, 因为它有可能在?mRNA 加工的过程中采用不 同的外显子重组方式? 3.下面叙述哪些是正确的?(? C? )? A.C 值与生物的形态复杂性呈正相关? B.C 值与生物的形态复杂性呈负相关? C.每个门的最小?C 值与生物的形态复杂性是大致相关的生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 6? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?4.选出下列所有正确的叙述。 A、C? )? (? A.外显子以相同顺序存在于基因组和?cDNA 中? C.人体内所有的细胞具有相同的一套基因? B.内含子经常可以被翻译? D.人体内所有的细胞表达相同的一套基因?E.人体内所有的细胞以相同的方式剪接每个基因的 mRNA?5.两种不同的酵母菌株进行杂交,经由营养生长阶段可形成大量二倍体细胞。如果用于检测的标记 基因来自亲本双方,那么经过几代营养生长后,二倍体细胞内(? D? A.含有来自单个亲本的线粒体基因标记? B.所有细胞克隆都含有来自双方亲本的核基因标记? C.可观察到来自单个亲本的核基因标记以及线粒体标记? D.A 与?B?正确? 6.下列关于酵母和哺乳动物的陈述哪些是正确的?(? A、B、D? )? ) 。?A.大多数酵母基因没有内含子,而大多数哺乳动物基因有许多内含子? B.酵母基因组的大部分基因比哺乳动物基因组的大部分基因小? C.大多数酵母蛋白质比哺乳动物相应的蛋白质小? D.尽管酵母基因比哺乳动物基因小,但大多数酵母蛋白质与哺乳动物相应的蛋白质大小大致 相同? 7.下列哪些基因组特性随生物的复杂程度增加而上升?(? A、B、D? A.基因组大小? C.基因组中基因的密度? B.基因数量? D.单个基因的平均大小? )? )?8.以下关于假基因的陈述哪些是正确的?(? D、E、F? A.它们含有终止子? C.它们不被翻译? E.它们会由于缺失或其他机制最终从基因组中消失? F.它们能进化为具有不同功能的新基因?B.它们不被转录? D.它们可能因上述任一种原因而失活?9.假基因是由于不均等交换后,其中一个拷贝失活导致的。选出下面关于此过程的正确叙述。 (? A? )生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?7?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.失活点可通过比较沉默位点变化的数量和置换位点变化的数量来确定? B.如果假基因是在基因复制后立即失活,则它在置换位点比沉默位点有更多的变化? C.如果假基因是在基因复制后经过相当长一段时间后才失活,则它在置换位点与沉默位点有 相同数量的变化? 10.下列哪些基因以典型的串联形式存在于真核生物基因组?(? B、C? A.珠蛋白基因? B.组蛋白基因? C.rRNA 基因? ) 。? )? D.肌动蛋白基因?11.根据外显子改组(exon?shuffling)假说(? A、C、D? A.蛋白质的功能性结构域由单个外显子编码?B.当?DNA 重组使内含子以一种新的方式结合在一起时,新基因就产生了? C.当?DNA 重组使外显子以一种新的方式结合在一起时,新基因就产生了? D.因为一些新的功能(蛋白质)能通过外显子的不同组合装配产生,而不是从头产生新功能, 所以进化速度得以加快?12.简单序列?DNA(? C、D?) 。? B.由散布于基因组中各个短的重复序列组成? D.根据其核苷酸组成有特异的浮力密度?A.与?Cot1/2?曲线的中间成分复性? C.约占哺乳类基因组的?10%? E.在细胞周期的所有时期都表达? 13.原位杂交(? A、C? ) 。?A.是一种标记?DNA 与整个染色体杂交并且发生杂交的区域可通过显微观察的技术? B.表明卫星?DNA 散布于染色体的常染色质区? C.揭示卫星?DNA 位于染色体着丝粒处? 14.非均等交换(? B、C、D、E? A.发生在同一染色体内? C.改变了基因组织形式,未改变基因的总数? ) 。? B.产生非交互重组染色体? D.在染色体不正常配对时发生?E.降低一个基因簇的基因数,同时增加另一个基因簇的基因数? 15.微卫星重复序列(? A、B、C? ) 。? A.每一簇含的重复序列的数目比卫星重复的少? B.有一个?10?15(2?6)个核苷酸的核心重复序列? C.在群体的个体间重复簇的大小经常发生变化? D.在?DNA 重组时,不具有活性? 16.细胞器?DNA 能够编码下列哪几种基因产物?(? A、B、C、D、E、F?生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 8?)/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.mRNA? D.tRNA?B.大亚基?rRNA? E.4.5S?rRNA? )? C.150kb?C.小亚基?rRNA? F.5S?rRNA?17.典型的叶绿体基因组有多大? (? C? A.1.5kb? 18.细胞器基因组(? A? A.是环状的? C.含有大量短的重复?DNA 序列? 19.叶绿体基因组含(? A? A.两个大的反向重复? C.两个短的单一序列?DNA? 20.酵母线粒体基因组(? ) 。? B.15kb? ) 。?D.1500kb?B.分为多个染色体?B.两个大的单一序列?DNA?A、C、D、E? ) 。?A.编码的基因数目与人线粒体基因组编码的基因数目大致相同? B.大小与人线粒体基因组大小大致相同? C.含有许多内含子,其中有些能编码蛋白质? D.含有?AT 丰富区? E.有几个功能未明的区域?21.在人类线粒体基因组中(? A、C、D?) 。?A.几乎所有的?DNA 都用于编码基因产物? B.几乎所有编码蛋白质的基因都从不同的方向进行转录? C.产生惟一一个大的转录物,然后剪接加工,释放出各种?RNA 分子? D.大多数编码蛋白质的基因被?tRNA 基因分隔开? 22.酵母的小菌落突变(? A、C、D? A.已失去全部线粒体的功能? ) 。? B.总是致死的?C.由编码线粒体蛋白质的细胞核基因突变引起? D.由线粒体基因组丢失或重排引起? 23.当细胞丧失端粒酶活性后,不会出现以下哪种情形?(? A.随着细胞每次分裂,端粒逐渐缩短? C.免疫系统逐步丧失某些防御机制? 24.以重量计,染色质的组成大致为(? A?生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?D? )?B.分裂?30?50 次后,出现衰老迹象并死亡? D.大量体细胞具有了无限分裂的能力? ) 。9? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.1/3DNA,1/3 组蛋白,1/3 非组蛋白?B.1/3DNA,1/3 组蛋白?C.1/3DNA,1/3 组蛋白,1/3 碱性蛋白质? D.1/4DNA,1/4RNA,1/4 组蛋白,1/4 非组蛋白? 25.染色质非组蛋白的功能不包括 (? D? A.结构? B.复制? ) 。? C.染色体分离? E? )期间彼此分离。? C.减数分裂?II? D.核小体包装?26.一个复制的染色体中,两个染色质必须在(? A.有丝分裂? D.A 与?B? B.减数分裂?I? E.A 与?C?27. 以下关于酵母人工染色体 (YAC) 在细胞分裂过程中发生分离错误的描述, 正确的是 (? D? A.11?000bp?的?YAC 将产生?50%的错误? C.长于?100?000bp?的?YAC 产生?0.3%的错误? 28.DNA 酶超敏感(DH)位点多数存在于(? A? ) 。? A.该细胞转录基因的?5&#39;区? C.临近组蛋白丰富区? 29.叶绿体中参与光合作用的分子(? B? A.全部由叶绿体基因编码? C.全部由核基因编码? ) 。? B.部分由叶绿体基因编码,其他由核基因编码? D.部分由核基因编码,其他由线粒体基因编码? ) 。? B.临近核小体区? D.以上都对?) 。?B.55?000bp?的?YAC 将产生?1.5%的错误? D.以上都对?30.关于细胞器基因组的描述不正确的是(? A?A.线粒体?DNA 及叶绿体?DNA 通常与组蛋白包装成染色体结构? B.线粒体基因的翻译通常可被抗生素(如氯霉素)抑制?fmet? C.与细菌类似,线粒体翻译过程中利用?N?甲酰甲硫氨酸以及?tRNA?D.以上描述都正确?31.分子生物学检测证实:DNA 序列可在(? D? )之间转移。? A.线粒体?DNA 与核?DNA? C.不同的叶绿体分子? B.叶绿体?DNA 与线粒体?DNA? D.以上都对?32.两种不同的酵母菌株进行杂交,经由营养生长阶段可形成大量二倍体细胞。如果用于检测的标 记基因来自亲本双方,那么下列哪个结果可在交配后短时间内就能观察到?(C) 。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?10?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.细胞内含有来自两个亲本的线粒体基因标记? B.细胞内含有来自两个亲本的核基因标记? C.来自两个亲本的核基因标记以及线粒体基因标记都存在? D.只含有单个亲本来源的核基因标记以及线粒体基本标记 三、判断题? 1.水蜥的基因组比人的基因组大。 (正确)? 2.高等真核生物的大部分?DNA 是不编码蛋白质的。 (正确)? 3.假基因通常与它们相似的基因位于相同的染色体上。 (错误)? 4.在有丝分裂中,端粒对于染色体的正确分离是必要的。 (错误)? 5.大多数持家基因编码低丰度的?mRNA。 (正确)? 6.所有真核生物的基因都是通过对转录起始的控制进行调控的。 (错误)? 7.所有高等真核生物的启动子中都有?TATA 框结构。 (错误)? 8.只有活性染色质转录的基因对?DNase?I 敏感。 (错误)? 9.内含子通常可以在相关基因的同一位置发现。 (正确)? 10.40%以上的果蝇基因组是由简单的?7bp 序列重复数百万次组成。 (正确)? 11.卫星?DNA 在强选择压力下存在。 (错误)? 12.组蛋白在进化过程中的保守性表明其维持染色质结构的重要功能。 (正确)? 13.复制完整染色体时,如果没有引物存在,DNA 聚合酶将不能起始?5&#39;端的复制。 (正确)? 14.如果移去一段? DNA? 将会干扰染色体的分离,而重新插入这段序列又可恢复染色体分离的稳定 性,则该?DNA 序列一定位于着丝粒之外。 (错误)? 15.酵母线粒体基因组较人线粒体的基因组大,并且编码带有内含子的基因。 (正确)? 16.植物线粒体基因组比动物线粒体基因组小。 (错误)? 17.线粒体?DNA 的突变频率较核内的?DNA 高?10 倍。 (正确) 四、简答题? 1.比较基因组的大小和基因组复杂性的不同。 一个基因组有两个序列,一个是?A,另一个是?B,各有?2000bp,其中一个是由?400bp?的序列重复? 5?次而成,另一个则由?50bp 的序列重复?40 次而成的,问: (1)这个基因组的大小怎样? (2)这个基因组的复杂性如何? 答: 基因组的大小是指在基因组中?DNA 的总量。复杂性是指基因组中所有单一序列的总长度。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 11? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?(1)基因组的大小是?4000 bp? (2)基因组的复杂性是?450?bp? 2.一个基因如何产生两种不同类型的?mRNA 分子? 答: 第一种是,一个原初产物含有一个以上的多聚腺苷化位点,能产生具不同?3‘端的?mRNA。 第二种是,如果一个原初转录产物含有几个外显子,发生不同的剪接,产生多种?mRNA。? 3.在一个克隆基因的分析中发现:一个含有转录位点上游?3.8kb?DNA 的克隆,其?mRNA 直接转录 活性比仅含有?3.1kb?上游?DNA 克隆的转录活性大?50 倍。这表明了什么? 答: 在转录起始位点上游的?3.1?3.8kb?处有一增强子。? 4.被加工的假基因与其他假基因有哪些不同?它是如何产生的? 答: 已加工过的假基因具有明显的?RNA 加工反应的印迹。 如缺少内含子, 有些在?3? ‘端已经经过加工。 推测已加工过的假基因是在基因转录成前体?mRNA、RNA 加工后,又经反转录形成?DNA,再将 反转录出的?DNA 重新整合进基因组。? 5.非转录间隔区与转录间隔区分别位于?rRNA 重复的什么位置?转录间隔区与内含子有何区别? 答:? rRNA 的非转录间隔区位于串联转录单位之间,而转录间隔区位于转录单位的?18S? RNA 基因与? 28S?RNA 基因之间。? 6.RNA 分子能被运到细胞器中吗? 答: 一般来说只有蛋白质才能被输入。但在锥虫线粒体基因组中没有发现?tRNA,? 7.什么证据表明细胞器与原核生物的关系比细胞器与真核生物的关系密切? 答: 细胞器蛋白质合成对抗生素的敏感性与原核生物相似。此外,细胞器核糖体蛋白和?RNA 聚合酶 亚基也与大肠杆菌中的同源??? 8.酵母?rho?小菌落突变株的线粒体?DNA 发生了什么变化?答:??? rho?酵母线粒体基因组具有大量的缺失和重复。剩余的?DNA 通过扩增形成多拷贝。?9.为什么动物中线粒体?DNA 进化的速率,几乎是核?DNA 的?10 倍? 答:生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 12? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?因为线粒体?DNA 复制过程中存在更多的错配,并且其修复机制的效率更低。? 10. 为什么研究者认为某些植物的 COX?II 基因是经由 RNA 的过渡, 从线粒体转移到了核基因组中? 答: 线粒体内发现的?COX?II 假基因含有一内含子,而核基因组内的?COX?II 基因已缺失了内含子。? 11.请描述?C 值矛盾,并举一个例子说明。 答:? C?值矛盾是真核生物单倍体组?DNA?总量与编码基因信息?DNA?总量差异大。对高等真核生物而 言,生物体基因组的大小与其复杂性没有直接关系。亲缘关系相近的生物?DNA 含量可能差异很 大。如一些两栖动物比其它两栖动物的?DNA 相差?100?倍。? 12.酵母?mRNA?的大小一般与基因的大小相一致,而哺乳动物?mRNA?比对应的基因明显小。为什 么? 答: 大部分基因含有内含子。? 13.在一个基因复制后,外显子发生突变的概率比内含子小。但是,所有?DNA 的突变率是相同的。 请解释原因。 答: 外显子发生突变使功能丧失而个体被淘汰,因此外显子受选择压力的作用。? 14.跳跃复制的结果是什么? 答: 产生串联的?DNA 序列。? 15.重复序列并不是在选择压力下存在,因此能快速积累突变。这些特性表明重复序列相互间应存 在很大的不同,但事实并不是这样的。请举例说明。 答: 如卫星? DNA? 的同源性是通过固定的交换来维持,它们通过不均等交换导致其中一个重复单元的增 加和另一个单元的消失。? 16.哪些细胞器带有自身的基因组?为什么这些细胞器带有自身的基因组? 答: 线粒体和叶绿体。 因为这两种细胞器具有不同于细胞质的独特的胞内环境。? 17.线粒体?DNA 的突变率与细胞核?DNA 突变率有什么不同?为什么? 答:生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 13? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?在哺乳动中,线粒体?DNA 的突变率比细胞核?DNA 的突变率高,但在植物中,线粒体?DNA 的突变 率比细胞核?DNA 的突变率低。 线粒体采用不同于细胞核的?DNA 聚合酶和?DNA 修复体系。? 18.人线粒体?DNA 的哪些特征表明了其基因组的组织方式具有经济性? 答: 基因组小,基因直接相连甚至重叠,仅出现一个启动子,一些基因甚至不包括终止密码。? 19.20 世纪?70 年代提出的“内共生假说” ,现已被接受为一种理论。有哪些分子生物学证据有力支 持了该理论? 答: (1)线粒体与叶绿体具有自身的基因组,并独立核基因组进行复制; (2)类似于原核?DNA,线粒体与叶绿体基因组不组装为核销小体结构; (3)线粒体基因利用甲酰甲硫氨酸作为起始氨基酸; (4)一些抑制细菌蛋白质翻译成的物质也抑制线粒体中蛋白质的翻译过程。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?14?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?第?4 章? DNA 复制一、填空题? 1.在?DNA 合成中负责复制和修复的酶是? DNA 聚合酶 。?2.染色体中参与复制的活性区呈?Y 开结构,称为?DNA 复制叉 。?3.在?DNA 复制和修复过程中,修补?DNA 螺旋上缺口的酶称为? DNA 连接酶? 4. DNA 复制过程中, 在 连续合成的子链称为 先导链 , 另一条非连续合成的子链称为 后随链 。?5.如果?DNA 聚合酶把一个不正确的核苷酸加到?3′端,一个含?3′→5′活性的独立催化区会将这 个错配碱基切去。这个催化区称为 6.DNA?后随链合成的起始要一段短的? 底物合成的。? 7. 复制叉上?DNA 双螺旋的解旋作用由? DNA 解旋酶 催化的, 它利用来源于?ATP 水解产生的能量 沿?DNA 链单向移动。? 8.帮助?DNA 解旋的 单链结合蛋白(SSB) 与单链?DNA 结合,使碱基仍可参与模板反应。15? /soft/?校正核酸外切 酶。? RNA?引物 ,它是由? DNA?引发酶 以核糖核苷酸为生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?9.DNA? 引发酶分子与? DNA? 解旋酶直接结合形成一个 引发体 单位,它可在复制叉上沿后随链 下移,随着后随链的延伸合成?RNA 引物。? 10.如果? DNA? 聚合酶出现错误,会产生一对错配碱基,这种错误可以被一个通过甲基化作用来区 别新链和旧链的判别的 错配校正(错配修复) 系统进行校正。?11.对酵母、细菌以及几种生活在真核生物细胞中的病毒来说,都可以在? DNA? 独特序列的 复制 起点 12.? 处观察到复制泡的形成。? 可被看成一种可形成暂时单链缺口(I? 型)或暂时双链缺口(II? 型)的可逆DNA? 拓扑酶核酸酶。? 13.拓扑异构酶通过在?DNA 上形成缺口 松弛 14. 真核生物中有五种?DNA 聚合酶, 它们是① 15?有真核?DNA 聚合酶 δ 和 超螺旋结构。? α ; ② β ; ③ γ ; ④ δ ; ⑤ ε ;?ε显示? 3&#39;→5&#39;? 外切核酸酶活性。二、选择题(单选或多选)? 1.DNA 的复制(? B、D? ) 。? B.遵循新的子链与其亲本链相配对的原则? D.是碱基错配最主要的来源?A.包括一个双螺旋中两条子链的合成? C.依赖于物种特异的遗传密码? E.是一个描述基因表达的过程? 2.一个复制子是(? C? ) 。?A.细胞分裂期间复制产物被分离之后的?DNA 片段? B.复制的?DNA 片段和在此过程中所需的酶和蛋白质? C.任何自发复制的?DNA 序列(它与复制起点相连)? D.任何给定的复制机制的产物(如单环)? E.复制起点和复制叉之间的?DNA 片段? 3.真核生物复制子有下列特征,它们(? C? ) 。? A.比原核生物复制子短得多,因为有末端序列的存在? B.比原核生物复制子长得多,因为有较大的基因组? C.通常是双向复制且能融合? D.全部立即启动,以确保染色体的?S 期完成复制? E.不是全部立即启动,在任何给定的时间只有大约 15%具有活性? 4.下述特征是所有(原核生物、真核生物和病毒)复制起始位点都共有的是(? A、C、D? ) 。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?16?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.起始位点是包括多个短重复序列的独特?DNA 片段? B.起始位点是形成稳定二级结构的回文序列? C.多聚体?DNA 结合蛋白专一性识别这些短的重复序列? D.起始位点旁侧序列是?A?T 丰富的,能使?DNA 螺旋解开? E.起始位点旁侧序是?G?C 丰富的,能稳定起始复合物? 5.下列关于?DNA 复制的说法正确的有(? D、E、F? ) 。? A.按全保留机制进行? C.需要?4 种?dNMP 的参与? E.涉及?RNA 引物的形成? 6.滚环复制(? B、D、E? )? B.可以使复制子大量扩增? D.是噬菌体 DNA 在细菌中最通常的一种复制方式? B.按?3′→5′方向进行? D.需要?DNA 连接酶的作用? F.需要?DNA 聚合酶?I?A.是细胞?DNA 的主要复制方式? C.产生的复制子总是双链环状拷贝?E.复制子中编码切口蛋白的基因的表达是自动调节的? 7.标出下列所有正确的答案。 (? B、C? )?A.转录是以半保留的方式获得两条相同的?DNA 链的过程? B.DNA 依赖的?DNA 聚合酶是负责?DNA 复制的多亚基酶? C.细菌转录物(mRNA)是多基因的? D.σ因子指导真核生物的?hnRNA 到?mRNA 的转录后修饰? E.促旋酶(拓扑异构酶?II)决定靠切开模板链而进行的复制的起始和终止? 8. 哺乳动物线粒体和植物叶绿体基因组是靠?D 环复制的。 下面哪一种叙述准确地描述了这个过程? (? C、D? )?A.两条链都是从?oriD 开始复制的,这是一个独特的二级结构,由?DNA 聚合酶复合体识别? B.两条链的复制都是从两个独立的起点同时起始的? C.两条链的复制都是从两个独立的起点先后起始的? D.复制的起始是由一条或两条(链)替代环促使的? E.ter 基因座延迟一条链的复制完成直到两个复制过程同步?9.DNA 多聚体的形成要求有模板和一个自由?3′?OH?端的存在。这个末端的形成是靠(? A、B、D、? E? ) 。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 17? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.在起点或冈崎片段起始位点(3′?GTC)上的一个?RNA 引发体的合成? B.随着链替换切开双链?DNA 的一条链? C.自由的脱氧核糖核苷酸和模板一起随机按?Watson?Crick 原则进行配对? D.靠在?3′端形成环(自我引发)? E.一种末端核苷酸结合蛋白结合到模板的?3′端? 10.对于一个特定的起点,引发体的组成包括(? A、C? ) 。?A.在起始位点与?DnaG?引发酶相互作用的一个寡聚酶? B.一个防止?DNA 降解的单链结合蛋白? C.DnaB?解旋酶和附加的?DnaC、DnaT、PriA 等蛋白? D.DnaB、单链结合蛋白、DnaC、DnaT、PriA 蛋白和?DnaG?引发酶? E.DnaB?解旋酶、DnaG?引发酶和?DNA 聚合酶?III? 11.在原核生物复制子中以下哪种酶除去?RNA 引发体并加入脱氧核糖核苷酸?(? A.DNA 聚合酶?III? C.DNA 聚合酶?I? E.DNA 连接酶? 12.使?DNA 超螺旋结构松驰的酶是(? C? ) 。? A.引发酶? D.端粒酶? B.解旋酶? E.连接酶? B? )? E.4 个以上 C.拓扑异构酶? B.DNA 聚合酶?II? D.外切核酸酶?MFI? C? )?13.从一个复制起点可分出几个复制叉?(? A.1? 三、判断题? B.2? C.3?D.4?1.大肠杆菌中,复制叉以每秒?500bp?的速度向前移动,复制叉前的?DNA 以大约定?3000r/min 的速 度旋转。(正确)? (如果复制叉以每秒? 500? 个核苷酸的速度向前移动,那么它前面的? DNA? 必须以? 500/10.5=48 周/秒的速度旋转,即?2880r/min)? 2. 所谓半保留复制就是以?DNA 亲本链作为合成新子链?DNA 的模板, 这样产生的新的双链?DNA 分 子由一条旧链和一条新链组成。(正确)? 3. “模板”或“反义”? DNA 链可定义为:模板链是被?RNA 聚合酶识别并合成一个互补的?mRNA, 这一?mRNA 是蛋白质合成的模板。(正确)? 4.DNA 复制中,假定都从?5&#39;→3&#39;同样方向读序时,新合成?DNA 链中的核苷酸序列同模板链一样。? (错误)? (尽管子链与亲本链因为碱基互补配对联系起来,但子链核苷酸序列与亲链又很大不同)? 5.DNA 的?5′→3′合成意味着当在裸露?3′→OH 的基团中添加?dNTP 时,除去无机焦磷酸?DNA生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 18? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?链就会伸长。(正确)? 6.在先导链上?DNA 沿?5′→3′方向合成,在后随链上则沿?3′→5′方向合成。(错误)? 7. 如果?DNA 沿?3&#39;→5&#39;合成, 那它则需以?5&#39;三磷酸或?3&#39;脱氧核苷三磷酸为末端的链作为前体。 (正确)? 8.大肠杆菌?DNA 聚合酶缺失?3′→5′校正外切核酸酶活性时会降低?DNA 合成的速率但不影响它 的可靠性。(错误)? 9.DNA 的复制需要?DNA 聚合酶和?RNA 聚合酶。(正确)? 10.复制叉上的单链结合蛋白通过覆盖碱基使?DNA?的两条单链分开,这样就避免了碱基配对。(错 误)? (单链结合蛋白与磷酸骨架结合,离开暴露碱基)? 11.只要子链和亲本链中的一条或两条被甲基化,大肠杆菌中的错配校正系统就可以把它们区别开 来,但如果两条链都没有甲基化则不行。(错误)? (亲本链甲基化,子链没有甲基化)? 12.大肠杆菌、酵母和真核生物病毒? DNA? 的新一轮复制是在一个特定的位点起始的,这个位点由 几个短的序列构成,可用于结合起始蛋白复合体。(正确)? 13.拓扑异构酶?I 之所以不需要?ATP 来断裂和重接?DNA 链,是因为磷酸二酯键的能量被暂储存在 酶活性位点的磷酸酪氨酸连接处。(正确)? 14.酵母中的拓扑异构酶?II?突变体能够进行?DNA?复制,但是在有丝分列过程中它们的染色体不能 分开。(正确)? 15.拓扑异构酶?I 和?II 可以使?DNA 产生正向超螺旋。 (错误)? 16.拓扑异构酶?I 解旋需要?ATP 酶。 (错误)? 17.RNA 聚合酶?I 合成?DNA 复制的?RNA 引物。 (错误)15.靠依赖于?DNA 的?DNA 聚合酶?I 所进 行的?DNA?复制要求有作为一个引发物的游离?3&#39;?OH?的存在。游离的?3′?OH?可以通过以下三种途 径获得:合成一个?RNA 引物、DNA 自我引发或者一个末端蛋白通过磷酸二酯键共价结合到一个核 苷酸上。(正确)? 18.当?DNA 两条链的复制同时发生时,它是由一个酶复合物,即?DNA 聚合酶?III 负责的。真核生 物的复制利用三个独立作用的?DNA 聚合酶,? Polα的一个拷贝 (为了起始) 和?Polδ的两个拷贝 (DNA? 多聚体化,当?MF1 将?RNA 引发体移去之后填入) 。(正确)? 19.从?oriλ开始的噬菌体复制的起始是被两个噬菌体蛋白?O 和?P 所控制的。在?E.coli 中?O 和?P 是? DnaA?和?DnaC?蛋白的类似物。基于这种比较,O?蛋白代表一个解旋酶,而?P 蛋白调节解旋酶和引 发酶结合。(错误)? 20.线粒体?DNA 的复制需要使用?DNA 引物。 (正确)? 21.在真核生物染色体?DNA 复制期间,会形成链状 DNA。 (错误) 四、简答题生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 19? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?1.描述?Meselson?Stahl?实验,说明这一实验加深我们对遗传理解的重要性。 答:? Meselson?Stahl?实验证实了?DNA 的半保留复制。证实了两个假说: (1)复制需要两条?DNA 的分离(解链/变性) (2)通过以亲本链作为模板,新合成的?DNA 链存在于两个复制体中。? 2.请列举可以在线性染色体的末端建立线性复制的三种方式。 答: (1)染色体末端的短重复序列使端粒酶引发非精确复制。 (2)末端蛋白与模板链的?5&#39;端共价结合提供核苷酸游离的?3&#39;端 (3)通过滚环复制,DNA 双链环化后被切开,产生延伸的?3&#39;?OH 端? 3.为什么一些细菌完成分裂的时间比细菌基因组的复制所需的时间要少?为什么在选择营养条件 下,E.coli? 中可以存在多叉的染色体或多达? 4?个以上的开环染色体拷贝,而正常情况下染色体是单 拷贝的? 答: 单拷贝复制由细胞中复制起点的浓度控制的。 在适宜的培养条件下,细胞呈快速生长,稀释起始阻遏物的浓度,使复制连续进行。? 4.在?DNA 聚合酶?III 催化新链合成以前发生了什么反应? 答:? DnaA(与每?9?个碱基重复结合,然后使?13?个碱基解链) 、DnaB(解旋酶)和?DnaC(先于聚合酶?III? 与原核复制起点相互作用。后随链复制需要引发体完成的多重复制起始,引发体由?DnaG?引发酶与 多种蛋白质因子组成。? 5.DNA 复制起始过程如何受?DNA 甲基化状态影响? 答: 亲本? DNA?通常发生种属特异的甲基化。在复制之后,两模板?复制体双链?DNA?是半甲基化的。半 甲基化?DNA 对膜受体比对?DnaA 有更高的亲和力,半甲基化?DNA 不能复制,从而防止了成熟前复 制。? 6.请指出在?oriC 或ΦX 型起点起始的?DNA 复制之间存在的重要差异。 答:? oriC 起点起始的?DNA 复制引发体只含有?DnaG。 ΦX?型起点起始的?DNA?复制需要额外的蛋白质―Pri?蛋白的参与。Pri?蛋白在引物合成位点装配引 发体。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 20? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?7. 大肠杆菌被?T2 噬菌体感染, 当它的?DNA 复制开始后提取噬菌体的?DNA, 发现一些?RNA 与?DNA? 紧紧结合在一起,为什么? 答: 该?DNA 为双链并且正在进行复制。RNA 片段是后随链复制的短的?RNA 引物。? 8.DNA 连接酶对于?DNA 的复制是很重要的,但?RNA 的合成一般却不需要连接酶。解释这个现象 的原因。 答:? DNA 复制时, 后随链的合成需要连接酶将一个冈崎片段的?5&#39;端与另一冈崎片段的?3&#39;端连接起来。 而? RNA 合成时,是从转录起点开始原?5&#39;→3&#39;一直合成的,因此不需?DNA 连接酶。? 9.曾经认为?DNA 的复制是全保留复制,每个双螺旋分子都作为新的子代双螺旋分子的模板。如果 真是这样,在?Meselson 和?Stahl?的实验中他们将得到什么结果? 答: 复制一代后,一半为重链,一半为轻链;复制两代后,1/4 为重链,3/4 为轻链。? 10.描述?Matthew 和?Franklin 所做的证明?DNA 半保留复制的实验。 答: (1)将大肠杆菌在?15?N 培养基中培养多代,得到的 DNA 两条链都被标记,形成重链。 (2)细胞移到?14?N 培养基中培养,提取?DNA; (3)将?DNA 进行氯化铯密度梯度离心, ; (4)经过一定时间后,DNA 在离心管聚集成带,每个带的密度均与该点的氯化铯溶液的密度相同; (5)照相决定每条带的位置和所含的?DNA 量。? 1)经?15?N 培养基,所有?DNA 都聚集在一条重密度带;? 2)经?14?N 培养基一代后,所有的?DNA 形成一条中间密度带;? 3)经?14?N 继续培养基一代,DNA 一半是中间密度带,另一半是轻密度带;? 4)最后,他们证明第一代的分子是双链,且为半保留复制。? 11.解释在?DNA 复制过程中,后随链是怎样合成的。 答:? DNA? 聚合酶只能朝? 5&#39;→3&#39;方向合成? DNA,后随链不能像前导链一样一直进行合成。后随链是 以大量独立片段(冈崎片段)合成的,每个片段都以? 5&#39;→3&#39;方向合成,这些片段最后由连接酶连接 在一起。每个片段独立引发、聚合、连接。? 12.描述滚环复制过程及其特征。 答:仅是特定环状?DNA 分子的复制方式。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 21? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?(1)复制过程:? 1)环状双链?DNA 的+链被内切酶切开;? 2)以?链为模板,DNA?聚合酶以+链的?3&#39;端作为引物合成新的+链,原来的+链?DNA?分子的?5&#39;? 端与?链分离;? 3)+链的?3&#39;端继续延长;? 4)引发酶以离开的+链为模板合成?RNA 引物,DNA 聚合酶以+链为模板合成新的?链;? 5)通常滚环复制的产物是一多聚物,其中大量单位基因组头尾相连。 (2)复制过程的特征:? 1)复制是单方向不对称的;? 2)产物是单链?DNA,但可通过互补链的合成转变为双链;? 3)子代?DNA 分子可能是共价连接的连环分子;? 4)连环分子随后被切成与单个基因组相对应的片段。第?5 章? DNA 重组一、填空题? 1.自然情况下,在同一基因两个稍微不同拷贝(等位基因)间发生重组的过程中,一个等位基因经 过 基因转变 过程会被另一等位基因代替。?2.通过 位点专一的 基因重组,游动?DNA 序列和一些病毒可进入或离开一条目的染色体。? 3. 一般性重组(同源重组) 中,基因交换发生的同源?DNA 序列间,最常见是发生在同一染色 体的两个拷贝。? 4.在交换区域,一个?DNA?分子的一条链与另一个?DNA?分子的一条链相互配对,在两个双螺旋间 形成一个 异源双链连接 。? ,两个单链的互补? DNA? 分子一起形成一个完全双链螺旋,人们认为这个反5.同过? DNA? 复性应从一个慢的 螺旋成核作用 步骤开始。? 6. 大肠杆菌的染色体配对需要? RecA 蛋白 , 它与单链?DNA 结合并使同源双链?DNA 与之配对。? , 也用它的发现者名字命名为? Holliday?7. 一般性重组 (同源重组) 的主要中间体是 交叉链互换 连接 。? 缺口 处开始。?8.重组通常从?DNA?9. 负责把?RNA 转录成互补?DNA 分子的 反转录 因转变。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 22?酶可以解释由 反转录病毒引起的永久性基/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?10. 利用自己的位点专一重组酶把自己从寄主基因组中的一个地方移到另一地方的遗传元件叫 座元件 ,也叫作 转座子 。?转11.酵母的?Tyl?元件是一种反转录转座子 ,它的转座需一段完整?RNA?转录物的合成,这个转录物又被复制成一个双螺旋?DNA,随后被整合到一个新的染色体位置。? 12.F 质粒的?IS 元件使?F 质粒与大肠杆菌染色体之间发生同源重组,产生一个? Hfr? 细菌。? 13.转座元件是指能 移动 到基因组其他位的? DNA? 序列。转座元件在以下方面影响基因组:能 够引起基因的 表达。? 14.最简单的转座元件是?IS 元件。IS 元件由两段短的 的负责转座的 转座酶 复序列。? 15. 复合 是通过 转座元件由两个?IS 元件与夹在中间的 抗生素 抗性基因组成。 有些转座元件的移动 反向 重复序列和一段夹在重复序列之间 重 重排 ,通过插入能够 灭活 基因,转座元件的启动子能够影响邻近基因的基因组成。 当整合到新位点后, 转座元件总是在靶位点产生一段 同向复制 转座的方式, 即在转座过程中在原位点保留一份转座元件的拷贝。 复制转座中产生 共整合中间体 , 解离酶 使这两份拷贝之间发生同源重组。而有些 与一个含两份转座元件的 元件则采用 非复制 重接 。转座方式, 转座元件在转座时不进行复制, 这种方式需要靶位点 断裂二、选择题(单选或多选)? 1.均等交换(? B、C、D、E? ) 。? A.发生在同一染色体内? C.改变了基因组织形式,未改变基因的总数? B.产生非交互重组染色体? D.在染色体不正常配对时发生?E.减少一个基因簇的基因数,同时增加另一个基因簇的基因数? 2.细菌基因组中几乎平均分配重组敏感热点,这些热点在大肠杆菌中称为?chi,它们(C、D) 。? A.是双链经常断裂的部位,可诱导重组? B.是单链经常断裂的部位,导致单链同化作用? C.是?RecBCD 复合物作用的位点,在这些位点,受双链断裂激活的?RecBCD 复合物 切开一个自由?3′?OH 端? D.是顺式作用元件,在该元件内可以产生一个单链的自由?3′?OH 端? E.是?RecA 蛋白结合的?DNA 位点,RecA 蛋白从该点沿着?DNA 移动直到断裂点? 3.以下(? E? )与维持细菌遗传信息的精确性无关。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 23? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.冗余? C.复制的精确机制? E.限制性内切核酸酶?B.复制酶? D.DNA 聚合酶的校对机制?4. C? )在产生遗传多样性的过程中非常重要。? (? A.翻译? B.转录? C.重组? D.转化? E.以上都不是?5.重组发生在减数分裂的(? C? )期。? A.后? B.间? C.前? D.中? E.以上都不是?6.重组包括来自(? A? )之间的断裂与重新结合。? A.同源的非姐妹染色单体? C.非同源的非姐妹染色单体? E.以上都不是? 7.IS 元件(? B、D? A.全是相同的? C.是旁侧重复序列?3? E.每代每个元件转座?10? 次?B.同源的姐妹染色单体? D.非同源的姐妹染色单体?) 。? B.具有转座酶基因? D.引起宿主?DNA 整合复制?8.组成转座子的旁侧?IS 元件可以(? A、B、C? ) 。? A.同向? C.两个都有功能? 9.复制转座(? A、C、D? ) 。? B.反向? D.两个都没有功能?A.复制转座子,即在原位点上留有一个拷贝? B.移动元件转到一个新的位点,在原位点上不留元件? D.要求有解离酶? C.要求有转座酶?E.涉及保守的复制,在这个过程中转座子序列不发生改变?10.非复制转座(?B、C、E?) 。?A.复制转座子,即在原位点上留有一个拷贝? B.移动元件到一个新的位点,在原位点上不留元件? C.要求有转座酶? D.要求有解离酶?E.涉及保守的复制,在这个过程中转座子序列不发生改变? 11.一个转座子的准确切离(? B? ) 。? B.恢复靶?DNA 到它插入前的序列A.切除转座子和两个靶序列?生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?24?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?C.比不准确切离更经常发生? 12.转座酶在非复制转座中所起的作用是(? A.切除转座子? C.将转座子移到新位点? A、B、D? ) 。?B.在靶位点产生一个交错切口? D.将转座子连到靶位点的交错切口上? A、C、D? )?13.关于在?Tn10 转座子上?dam?甲基化效应的陈述哪些是对的?(?A.在?IS10R?反向重复序列上,一个位点的甲基化可以阻断转座酶的结合? B.PIN?中的一个位点被甲基化可以刺激转座酶的转录??? C.Tn10 转座在?dam?突变中增加?1000 倍?D.复制后甲基化位点立即半甲基化,允许转座酶表达和作用? 14.玉米控制因子(? A、B、C、D? ) 。?A.在结构和功能上与细菌转座子是相似的? B.可能引起染色体结构的许多变化? C.可能引起单个玉米颗粒的表型发生许多变化? D.在植物发育期间的不同时间都有活性? 15.Ds 元件(? B、C、D? ) 。? B.是染色体断裂的位点? D.内部有缺失? F.靠一种非复制机制转座? A、B、C、D? )? D.onc?A.是自主转座元件? C.与?Ac 元件相似? E.没有末端倒位重复?16.下面哪些是在反转录病毒中发现的基因?(? A.gag? 17.反转录病毒?LTR(? B.pol? B、C? ) 。?C.env?A.在病毒基因组的?RNA 中发现? B.整合到宿主染色体上产生? C.包含一个强启动子? 18.宿主染色体在反转录病毒整合位点上会发生什么?(? A.4?6 个核苷酸被切除? C? )?B.4?6 个核苷酸在整合的一边被复制而在另一边被切除?C.4?6 个核苷酸在整合的每一边都被切除? D.2 个核苷酸从右边被切除? E.2 个核苷酸从左边被切除?19.下面哪些是?LTR 的组分?(?A、C、D?)生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?25?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.U3?B.U4?C.R? B、C? ) 。?D.U5?20.反转录病毒的整合酶(?A.是一种位点特异性内切核酸酶? C.在靶?DNA 上产生交互切口? 21.δ元件 (? A、B? ) 。?B.在?LTR 上起外切核酸酶的作用?A.是具有活性的启动子? 22.Copia 元件(? C? ) 。?B.当?Ty 转座时可留在基因组?DNA 后面?A.在果蝇基因组中约有?20?000 个拷贝? C.两侧为定向重复? E.与反转录病毒的?env 基因有同源性? 23.L1 元件(? A、B、D、E、F? ) 。?B.串联排列? D.不被转录?A.是病毒反转录转座子超家族的成员? B.每个哺乳动物基因组中有?20?000?50?000 个拷贝? C.大约长?300bp? ? ? ? D.包括一个可读框,产物与反转录酶有同源性? E.被转录? 23.Alu 因子(? C、E? F.有?LTR? ) 。?A.是病毒反转录转座子超家族的成员? B.每个哺乳动物基因组中有?20?000?50?000 个拷贝? C.大约长?300bp? E.被转录? D.包括一个与反转录酶基因有同源的可读框? F.有?LTR? )?24.下面哪些关于?Alu 序列的描述是正确的?(? B、E? A.所有?Alu 序列都是相同的?B.Alu 序列来源于有翻译功能的?7SL?RNA? D.Alu?序列永远不会存在于结构基因中?C.Alu 序列是靠?RNA 聚合酶?II 转录的?E.这些序列有一个区段与病毒的?DNA 复制起点同源? 25.转座子引起的突变可类似于缺失突变的效果:基因的功能完全丧失。现有一青霉素抗性的突变 菌株,经过?Tn5?侵染后,失去了青霉素抗性,试解释原因?(? A.转座子改变了细菌的代谢过程? C? )?B.转座子影响了细菌细胞壁的合成过程?C.转座子插入编码β?内酰胺酶的基因内部,使之失活? D.转座子使细菌通过其他机制抵御青霉素作用? E.无法解释?26.噬菌体?Mu 是一个转座子,长度为?44kb,含有转座酶基因,两端有反向重复序列。通过在细菌 基因组内基因间的“跳跃”形式进行复制,每“跳跃”一次就产生一个突变。将?Mu 导入大肠杆生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 26? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!??? 菌,获得一个?lac?突变子,怎样确定该突变是由?Mu 引起的?(? D?/ky/?)?A.克隆该基因,测序,寻找其中是否含?Mu 序列? B.克隆该基因到质粒载体上,并转化其他细菌观察是否出现突变子? C.构建一个基因文库,并以?Mu?序列及?lacDNA?为探针,筛选文库,看两种探针是 否与同一?DNA 片段杂交? D.以上方法都适用三、判断题? 1.λ噬菌体整合到大肠杆菌基因组上是由一个位点专一的拓扑异构酶(λ整合酶)催化的,它可以 识别在两条染色体上短的特异?DNA 序列。 (正确)? 2.所有已知的基因转变都需要一定量的?DNA 合成。 (正确)? 3.一般性重组需要交换的双方都有一长段同源?DNA 序列,而位点专一重组仅需要短而专一的核苷 酸序列,某些情况下,只需要交换双方中的一方具有序列即可。 (正确)? 4.一般性重组包括?DNA 片段的物理交换,该过程涉及?DNA 骨架上磷酸二酯键的断裂和重新形成。 (正确)? 5.RecA?蛋白同时具有位点专一的单链切割的活性和将单链从双螺旋?DNA?分子上解离的解旋酶的 功能,后一功能依赖于?ATP 活性。 (错误)? 6.大肠杆菌的单链结合蛋白通过与糖?磷酸骨架结合并使碱基暴露,从而解开单链上的短发夹结构。 (正确)? 7.RecA 蛋白同时与单链、双链?DNA 结合,因此它能催化它们之间的联会。 (正确)? 8. 交叉链互换包括交叉链和未交叉链, 至少其中一条链的磷酸骨架断裂才可能使这个过程逆转。 (错 误) (可通过旋转相互转变)? 9.基因转变是真菌类偶然改变性别的方式。正常情况下,一次接合产生等量的雄性与雌性孢子,但 偶然也会出现?1:3 或?3:1 的比例。 (错误) (基因转变于性别无关)? 10.反转录病毒侵染常常同时导致子代病毒的非致死释放和被侵染细胞内致癌的永久性基因改变。 (正确)? 11.转座酶可以识别整合区周围足够多的序列,这样,转座子不整合到基因的中间,因为破坏基因 对细胞是致死的。 (错误)? 12.转座要求供体和受体位点之间有同源性。 (正确)? 13.TnA?家庭的转座子通常转移三种基因:转座酶、解离酶和氨苄抗性基因。 (正确)? 14.Tn10?是高水平表达转座酶。 (错误)生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 27? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?15.IS 元件是一种能够给宿主菌“带来”新表型的质粒。 (错误) 四、简答题? 1.Holliday 重组模型经过修正,现成为同源重组模型。简述该模型的五个特点。 答: (1)同源配对的链发生断裂,经过部分交换并重新结合; (2)断裂及修复产生交互的产物; (3)重组可发生在?DNA 的任何位置; (4)交换过程是精确的,没有核苷酸的添加于丢失; (5)基因的转变可造成两个不同等位基因的不等量。? 2.为什么基因内互补只发生在:①某一基因座的等位基因间;②这些基因座的特殊等位基因对间? 答: (1)只有当活性蛋白质是两个相同多肽亚基的二聚体时,才发生基因内互补; (2)只有当两个突变的多肽链以精确互补的方式发生改变时,两个变化的亚基才能二聚化形成 有活性的蛋白质。? 3.反转录病毒与反转录转座子有什么不同? 答: 反转录转座子是指通过? RNA? 实现转座的遗传元件。反转录病毒是由一列反转录转座子构成含? RNA 基因组的侵染颗粒。? 4.gag 和?pol 基因的蛋白质产物是怎样生成的?mRNA 编码的?Env?蛋白是怎样生成的? 答: 反转录病毒的所有结构蛋白均是由单个初级转录物翻译合成的,其中第一个合成的蛋白质为? Gag?蛋白。 为了合成?Pol 蛋白,? 基因的终止密码子必需被抑制或核糖体移动读码框。 gag 这样?Pol? 蛋白只是以?Gag?Pol?融合蛋白的状态存在,最后由病毒蛋白酶剪切。Env?蛋白是通过?mRNA?可 变剪接合成的。? 5.蛋白酶为什么对反转录病毒生活史很重要? 答: 翻译?Gag?蛋白、Pol?蛋白、Env?蛋白之后,病毒蛋白酶分别将切割成?2?3?个有活性的蛋白质片 段。? 6.噬菌体整合到宿主基因组后,4?6?个宿主? DNA?的核苷酸被复制,这是为什么?这与转座子插入 新位点有何相似之处?另外,2 个核苷酸从?5&#39;端?U3&#39;的?5&#39;和?3&#39;? 端?U3&#39;的?3&#39;被切除,这意味着遗传 信息从反转录病毒中丢失吗?生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 28? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?答: 因为反转录病毒整合酶在整合位点切开一个交错切口,造成靶位点重复。插入后,填补切口产 生同向重复序列。 病毒基因组每侧?2 个核苷酸的缺失并不会导致基因组另一端序列的其他拷贝的缺失。? 7.反转录病毒怎样获得像? onc? 基因这样的细胞基因?获得此类基因会对反转录病毒基因产生影响 吗?一个反转录病毒怎样才会丢失如?pol 和?env 这样的重要的基因而复制? 答: 当整合的原病毒和邻近细胞基因之间出现缺失,反转录病毒可获得细胞基因; 原病毒启动子起始的转录产生一融合?mRNA,剪接后被包装进病毒颗粒。 当病毒获得宿主?DNA?时可丢失诸如?pol?和?env?等病毒基因,但这样的病毒自身进行复制,必须 依赖于野生型病毒的辅助。? 8.描述酵母?Ty 元件的结构。它与反转录病毒有何相似之处?为什么它不形成感染粒子? 答: Ty? 元件的每一端均有一个同向重复序列(δ元件) 。Ty? 元件有两个可读框,与反转录病毒的? gag 和?pol 基因具同源性。第二个可读框的翻译需要核糖体的移码,正如反转录病毒的?pol 基因。? Ty?元件缺少基因。? 9.你如何证明?Ty 元件在转座时经历了一个?RNA 中间体? 答: 构建一个含内含子与δ元件的人工? Ty? 元件。采用诱导型? GAL? 启动子合成大量的? Ty? 元件的? mRNA,从而使这一元件整合到基因组新位点的转座频率增加。检测新插入的?Ty 元件。若具有 δ元件但缺少内含子,则通过?RNA 的中间体。? 10.FB?元件与?copia 因子有何不同? 答:? FB?元件两端为反向重复序列,而?copia 两端为同向重复序列。? 11.列出病毒和非病毒超家族反转录转座子之间的?4 种差异。 答: 病毒超家族反转录转座子具长末端重复序列? LRT、编码反转录酶或整合酶的可读框和内含子, 非病毒反转录转座子不含有这些序列; 病毒反转录转座子的整合会在靶位点产生一段? 4?6? 个核苷酸的重复,而非病毒反转座子则产生? 7?21 个个核苷酸的重复。? 12.为什么说?Alu 元件可能作为?DNA 复制的起点?有什么理由不支持这种假说呢?生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 29? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?答:? Alu 元件含有?14 个核苷酸,与一些病毒的?DNA 复制起点相近;? Alu 元件在基因组的数量超过了估计的复制起点的?10 倍。? 13.描述两种转座子引起基因组重排的方式。 答: 转座子转座时能够导致基因序列的缺失、重复或插入; 转座子通过宿主重组系统导致基因重排。? 14.IS 元件整合到靶位点时会发生什么? 答: 转座子插入前产生交错缺口,插入后填补导致靶位点序列重复。? 15.一个复合转座子和一个?IS 元件之间的关系是什么? 答: 复合转座子在两个末端有?IS 序列。? 16.列出一个转座子插入到一个新位点所要求的步骤。 答: (1)在靶位点产生缺口; (2)切除转座子; (3)转座子与靶位点连接; (4)填补插入位点两端的单链区。? 17.当①DNA 在两个同向重复之间②DNA 在两个反向重复之间发生重组的效应各是什么? 答: (1) 同向重复之间发生重组会导致重复序列间的序列缺失; (2)反向重复间的重组会使重复序列间的序列倒位。? 18.在什么过程中会形成一个共整合体?它的结构是什么? 答: 在复制转座中会形成一个共整合中间体, 其中含有两个方向相同的转座子拷贝, 并由原复制子隔 开。? 19.Tn10?元件只有在自己的转座酶基因具有活性时发生转座(与利用基因组中?Tn10?元件表达的转 座酶的情况正好相反) ,这种偏爱的原因是什么? 答: 转座酶一旦合成就立即与? DNA? 结合,以免扩散到基因组的其它组件中。有假说认为转座的半生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 30? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?衰期很短,若与?DNA 结合则较为稳定。? 20.什么是杂种不育?是怎样引起的? 答: 杂种不育是出现在果蝇特定品系杂交后代中的一系列染色体畸形。是由一个亲本染色体中? P? 元 件活性引起。如果母本不具?P 元件,产生的卵细胞缺失?P 元件编码的转座阻遏蛋白,则会激化?P? 元件。? 21.为什么?F 质粒整合细菌基因组中,会产生不同的?Hfr 细菌? 答:? F 质粒通过?IS 序列与基因组中的?IS 位置进行同源重组,由于细菌中有多个不同的?IS 序列,产 生不同的?Hfr 细菌。??? +? 22.区别?F?、F? 、Hfr、F′几个不同的概念。答:??? +? F?不含?F 质粒;F? 含?F 质粒;Hfr 含有整合型的?F 质粒;F′细胞中的?F 质粒携带有部分细菌基因组的成分。第?6 章 突变与修复第十二章 突变一、填空题? 1.产生单个碱基变化的突变叫作 的 密码子 点 突变,如果碱基的改变产生一个并不改变氨基酸残基编码 同义 突变。如果改变了氨基酸残基,并且不会造成什么影响,这就是 错义 或的密码,这就是 在蛋白质 二级突变。这种突变对蛋白质功能影响程度要根据被改变的氨基酸残基 三级 结构中的重要程度,或是与酶的 活性位点 的密切性来决定,活性变化范围可从 零 到接近正常。? 2.一种由于蛋白质序列中丢失了 种蛋白质更容易 变性 半光氨酸 残基引起的突变将会阻止 二硫 温度是稳定的而在 较高 桥的形成,这 温度是不稳定的,。如果在较低31?生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?将它称为温度敏感 突变,是条件致死 突变的一个例子。? 转变成 终止 密码子,结果使蛋白质链 变短 。 可读框 的移动,突变位置 下游3.无义突变是将一种氨基酸的 一个碱基的插入或 缺失 叫密码子译码 突变。由于三联的整个氨基酸序列都会被改变。上述两种类型的突变(插入和缺失)所产生的蛋白质同 野生型 不同,通常是完全 失活 。?4.下面各句是对不同诱变剂作用的叙述,写出相应情况的诱变剂的名称: (1)通过同双螺旋的结合,引起变构,并激活修复性内切核酸酶的诱变剂是吖啶类染料。 (2)引起总染色体的损伤如断裂和转位的诱变剂是 α、β或γ射线 。(3)取代正常的碱基而掺入到?DNA 中,并通过互变异构引起复制错误的诱变剂是?5?溴尿嘧啶,? 2?氨基嘌呤。 (4)只能够除去胞嘧啶和甲基胞嘧啶的的氨基基团的诱变剂是 (5)主要是引起同一条链上的相邻嘧啶间的交联的诱变剂是 羟胺 紫外线 。 。(6)主要是在? DNA? 双螺旋的形变和链的错排过程中引起插入或缺失的诱变剂是 吖啶类染 料 。 。?(7)可以除去?DNA 中任何一个带有氨基基团的碱基上氨基基团的诱变剂是 亚硝酸?5? 5.据估计,单倍体人基因组包括?30000 个基因,如果每个世代每个基因的突变率为?5×10? ,那么,每个个体中存在??5? 2×30?000×5×10? =3 个刚产生的突变。? 脱6.? DNA 中两种常见的自发突变是由于腺嘧呤、 鸟嘌呤与脱氧核糖间的 N?糖基连接断裂而导致的 嘌呤作用 和使胞嘧啶变为尿嘧啶而导致的 脱氨基作用 。?7.在大肠杆菌中发现了? 3? 种?DNA 聚合酶。DNA 修复时需要?DNA 聚合酶? III? 。? 8. 在?DNA 修复过程中, 需要第二种酶,? 接 起来。 从? DNA? 连接酶 , 作用是将?DNA 中相邻的碱基 连原核生物? DNA?聚合酶具有外切核酸酶的活性。有两种外切核酸酶的活性,它们分别 3&#39;→5&#39;? 降解?DNA。DNA 聚合酶? II? DNA? 修复 只有? 3&#39;→5&#39;? 外切核酸酶活性。?5&#39;→3&#39;? 和?9.DNA? 大多数自发变化都会通过称之为?的作用很快被校正。仅在极少情况下,? 突变 。?DNA 将变化的部分保留下来导致永久的序列变化,称为10.? DNA 修复包括三个步骤:? DNA 修复核酸酶 对?DNA 链上不正常碱基的识别与切除,? DNA? 聚合酶 对已切除区域的重新合成,? DNA 连接酶 对剩下切口的修补。? 11.一种主要的?DNA 修复途径称 碱基切除修复 ,包括一系列? DNA 糖基化 酶,它们都能识别 并切去?DNA 上不正常碱基。? 12. 核苷酸切除修复 途径可以切去任何造成?DNA 双螺旋大片段改变的?DNA 损伤。? SOS?反应 的信号,即允13.大肠杆菌中,任何由于?DNA?损伤造成的?DNA?复制障碍都会诱导?生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 32?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?许跨过障碍进行复制,给细胞一个生存的机会。? 14.下面所列的是由突变而产生的一些异常表型? I,同时也列出了表型由突变而造成的缺陷的可能 原因?II。请尽可能地将?I 项所列的异常表型同?II 项所列的可能原因配对。? I?异常表型:? A.细菌的营养缺陷型? B.细菌温度敏感突变体? C.细菌的诱导酶变成组成酶? D.果蝇的红眼变成白眼? E.果蝇形成两个胸节? F.人的镰状细胞贫血症? G.人的原卟啉症? H.人着色性干皮病? I.苯丙酮尿症? J.人肿瘤的发生 II?缺陷可能出现在:? a.? 合成途径? b.? 降解途径? c.?DNA 的修复? d.? 转录控制? e.? 细胞分裂控制? f.? 胚胎发育控制? g.? 蛋白质的稳定性?二、选择题(单选或多选)? 1.理论上自发突变是随机发生的,并均匀分布于基因组中,然而,精细分析表明,DNA?中的某些 位点较其他位点更易发生突变。这些“热点”突变是由于(? B? ) 。? A.DNA 的空间结构选择性地使部分?DNA 暴露在诱变因子的作用? B.存在可被进一步修饰(如脱氨基)的已修饰碱基(如甲基化) ,导致碱基转换并通 过复制产生突变? C.被修饰(如甲基化)碱基的存在,易于发生错配复制并因此产生突变? D.DNA 中富含?A?T 区域的存在,使得自发解链及错配碱基的掺入? E.对沉默突变的选择压力很低,因此热点多为密码子第三位的碱基? 2.置换位点突变(? C? ) 。? B.比沉默位点突变更为经常?A.并不改变编码蛋白质的序列? C.与沉默位点突变的发生率相同?3.一种突变细菌从群落形态学(即表型)不能与其野生型相区别,这一突变可能是(? E? ) 。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 33? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.一个点突变? C.密码子第三个碱基的替换? E.A 和?C?B.一个无义突变或错义突变? D.A 和?B?4.通过突变分析最终将“基因”确定为遗传单位后,就必须从分子水平评价基因的功能。这一问题 的成功解决是由于发现了(? C? ) 。?A.显性等位基因上的突变使其表型类似隐性基因? B.突变基因不能编码产生存在于野生型个体中的蛋白质? C.突变基因的蛋白质产物与野生型基因的产物有差别? D.营养缺陷型细菌只有经过致突变剂处理后才能在基本培养基上生长? E.具突变表型的配子与野生型配子所形成的杂合子常表现为野生型表型? 5. 假设为了鉴别一个特定的基因, 已经成功得到了一种可选择的细菌突变株。 可是为了更具说服力, 必须证明观察到的突变表型就是该基因突变导致的,可采取的方法是(? E? ) 。? A.用致突变剂处理细菌,并且分离一个回复野生型表型的突变体? B.用携带突变基因的质粒转化突变株后不能回复为野生型,即不能得到反式互补? C.用携带突变基因的质粒转化野生型菌株后,不能产生突变表型,即不能得到反式互补? D.用携带突变基因的质粒转化突变菌株后可以产生野生型表型,即可以反式互补? E.用携带突变基因的质粒转化突变菌株后可回复野生型表型,即可以反式互补? 6.突变是指(? D? ) 。? B.导致新蛋白质合成的?DNA 内的改变? D.细胞内可遗传的?DNA 改变?A.导致新表型出现的?DNA 内的改变? C.细胞内?DNA 发生的任何的任何改变?E.导致细胞生存概率发生变化的任何改变? 7.一段野生型序列?5′?AGCCTAC?3′,如发生碱基颠换的可能结果是(? A.5′?AGTCTAC?3′? C.5′?AGCCCAC?3′? E.5′?AGCCTGC?3′? 8.哪一类型的突变最不可逆?(? A? )? A.缺失? B.转换? C.颠换? D.插入? D? ) 。?B.5′?AGCCGCCGCCGCCTAC?3′? D.5′?ATCCTAC?3′?E.以上突变不可逆的程度相当? 9.Luria?Delbruck?波动实验说明(? D? ) 。生物秀下载平台――专业生物资源下载平台?34?/soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?A.细菌具有天然的噬菌体抗性? B.所有细菌群体都具有低水平的噬菌体抗性? C.细菌在接触噬菌体之后会产生对噬菌体的抗性? D.细菌由于随机的自发突变产生噬菌体抗性? E.噬菌体突变子可形成边缘清晰的大型噬菌斑?10.引起遗传性色素干皮病的原因是(? A?) 。? B.不能合成苯丙氨酸? D.不能校正转换突变?A.不能校正紫外诱发形成的碱基二聚体突变? C.不能产生具有功能的血红蛋白? E.X 染色体断裂? 11.不等交换造成(? E? ) 。?A.非同源染色体之间的交换? C.紫外线诱导损伤的修复? E.缺失以及重复?B.遗传物质的丢失? D.含有?Y 染色体卵子的形成?12.引起精神紊乱症状的?X 染色体脆性遗传病,其致病原因是(? A.体内产生可裂解磷酸骨架的酶? C.X 射线? B.紫外线辐射?E?) 。?D.配子中有一条多余的?X 染色体?E.染色体上一段三碱基序列发生多次重复? 13.通过埃姆斯测试法,检测一种甜味剂的致突变性。结果如下: 样品 蒸馏水? 蒸馏水+鼠肝酶? 甜味剂? 甜味剂+鼠肝酶? 从以上结果可得出什么结论?(? C? )? A.该甜味剂不具有诱变性? B.鼠肝酶是强诱变剂?+? 回复?His? 的克隆数/个2? 3? 6? 65?C.该甜味剂不是诱变剂,但可能代谢转化为强诱变剂? D.该甜味剂是诱变性,并可转化为强诱变剂? E.该甜味剂及其转化产物具有相等的诱变性? 14.研究某种花卉的花色基因,有三种等位基因:深蓝、白色、天蓝,同配子的植株的花色即为等 位基因所决定的花色。而异配子植株中,存在不完全显性及中间色的情况。则这三种等位基因将生物秀下载平台――专业生物资源下载平台? 35? /soft/? 生物秀考研频道――您的考研助手!?/ky/?产生多少种可能的花色表型(? A.9? B.2?D? C.4?)? D.6? E.8?15.假设某基因中,一个等位基因发生了负显性突变,该基因编码的蛋白质在细胞内以三聚体形式 存在。如果一个亚基的突变可导致整个蛋白质的失活,那么一个异配子个体中,多少比例的三聚 体蛋白质是无活性的?(? A.100%? B.25%? E? )? C.50%? D.6.25%? E.12.5%?16.关于?DNA 的修复,下列描述中哪些是不正确的?(? B、C? )? A.UV 照射可以引起嘧啶碱基的交联? C.双链的断裂可以被?DNA 聚合酶?II 修复? B.DNA 聚合酶?III 可以修复单链的断裂? D.DNA 的修复过程中需要?DNA 连接酶?E.细菌可以用一种核酸内切酶来除去受损伤的碱基? F.糖苷酶可以切除?DNA 中单个损伤的碱基? 17.DNA 最普遍的修饰是甲基化,在原核生物中这种修饰的作用有(? A.识别受损的?DNA 以便干修复? B.复制之后区分链,以确定是否继续复制? C.识别甲基化的外来?DNA 并重组到基因组中? D.保护它自身的?DNA 免受核酸内切酶限制? E.识别转录起始位点以便?RNA 聚合酶能够正确结合? 18.单个碱基改变是?DNA 损伤的一种形

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