近日,国际顶级学术期刊《Nature》及其子刊,连续发表了3篇关于精神分裂症的相关研究,揭示了该症与基因之间的联系。
罕见的编码变异历来为基因功能和疾病发病机制提供了最直接的联系。通过对24248例精神分裂症患者和97,322例对照组的全外显子进行元分析,研究人员认为10个基因的极罕见编码变异(URVs)具有精神分裂症的重大风险和。
这些基因在中枢神经系统神经元中表达量最大,具有多种分子功能,包括突触的形成、结构和功能。在精神分裂症、自闭症谱系障碍、癫痫和严重的神经发育障碍中观察到一些重叠的罕见变异风险,尽管不同的突变类型涉及到一些共享的基因。然而,这里描述的大多数基因与神经发育无关。研究证明,从精神分裂症的常见变异分析中优先排序的基因在罕见变异风险3中富集,这表明常见和罕见遗传风险因素至少部分地在相同的潜在致病生物学过程中趋同。即使排除了显著相关的基因,精神分裂症病例仍然携带大量过量的urv,这表明更多的风险基因等待使用这种方法发现。
精神分裂症的遗传率为60 - 80%,其中大部分可归因于常见的风险等位基因。在一项涉及76755名精神分裂症患者和243649名对照组患者的两阶段全基因组关联研究中,研究人员发现了287个不同基因组位点的共同变异关联。关联集中在中枢神经系统的兴奋性和抑制性神经元中表达的基因,而不是在其他组织或细胞类型中。利用精细定位和功能基因组数据,研究人员确定了120个基因(106个蛋白质编码),这些基因可能支持这些位点中的一些关联,包括16个具有可信的因果非同义或非翻译区域变异的基因。这也暗示与神经元功能相关的基本过程,包括突触的组织,分化和传递。在精神分裂症患者中,精细定位的候选基因与罕见的破坏性编码变异相关,包括谷氨酸受体亚基GRIN2A和转录因子SP4,在神经发育障碍中与此类变异相关的基因也丰富。研究人员确定了与精神分裂症病理生理学相关的生物学过程;在精神分裂症和神经发育障碍中表现出常见和罕见的变异关联;并提供优先排序的基因和变异资源,以推进机制研究。
研究人员报道了双相情感障碍外显子组(BipEx)协作分析的结果,对13933名双相情感障碍(BD)患者和14422名对照组进行了全外显子组测序。研究人员发现,在两种主要BD亚型中,在强进化约束的基因下,BD患者中存在过量的超罕见蛋白截断变异(PTVs)。然而,BD的全基因组关联研究(GWASs)所涉及的基因在超罕见的ptv中并没有显著富集。将基因水平的结果与SCHEMA结合,AKAP11成为最终的风险基因(比值比(OR)