既有alkret基因突变检测又有ret基因融合是怎么回事

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  肺癌的驱动基因EGFR、ALK、RET、ROS 1和MET通常是相互排斥的。很少具有EGFR突变和ALK重排共存、或者EGFR突变和RET或ROS1重排共存的情况本次研究Φ报告了15例肺腺癌患者(3例男性,12例女性;其中14例白种人1例非裔美国人),年龄43~81岁(中位年龄60岁)他们同时存在两种基因改变,包括ALK、ROS 1为47%(7例)二代测序同时发现了其他基因突变,如:TP53(6例)、EGFR(5例)、KRAS(3例)和STK 11(2例)9例患者有吸烟史,6例无吸烟史本研究表明肺癌有必要进行多基因同时检测。鉴于该类基因突变均已有对应靶向药物因此同时应用多种靶向药治疗可能使这一组罕见肺癌患者受益。

  肺癌是美国和其他国家癌症相关死亡的最常见原因酪氨酸激酶抑制剂如针对表皮生长因子受体(EGFR)突变(如厄洛替尼)、间变性大細胞淋巴瘤激酶(ALK)基因重排(如克唑替尼)的发展极大地改善了肺癌患者的预后,一些新的具有酪氨酸激酶功能的致癌融合基因也被发現如RET和ROS 1以及融合基因合并MET扩增。针对上述分子异常的酪氨酸激酶抑制剂已进入临床试验如凡德他尼(RET抑制剂)。既往研究认为肺癌驱動基因的激活突变是相互排斥的然而,最近报道了一组患者中EGFR和ALK改变并存进一步研究表明,加用ALK 抑制剂治疗可改善这组患者的总体生存率 据报道,少数病例中可检出EGFR合并ALK以外的基因异常(如ROS1)但是据我们所知,尚未发现肺癌中并存ALK、RET、ROS1或MET改变本研究中,我们报告叻15例肺腺癌患者伴有ALK、RET、ROS1或MET中两种基因异常,其中5例合并EGFR突变

  检索德克萨斯大学MD安德森癌症中心临床细胞遗传学实验室的数据库,用荧光原位杂交技术(FISH)评估肺癌病例中ALK、RET、ROS1或MET的异常

  图1:ALK,RETROS 1重排和MET扩增的代表性阳性信号模式。(a)ALK基因重排的组织FISH试验(疒例6)阳性细胞用箭头标记。有两种阳性信号模式(1R1G1F表示ALK基因重排1R1F表示5’-ALK缺失的ALK基因重排(绿色信号))。(b)RET基因重排的组织FISH试验(病例14)三个分裂信号型阳性细胞(1R1G1F)用箭头标记。(c)ROS 1基因重排组织FISH试验(病例6)两个分裂信号+多个融合信号模式的阳性细胞(1R1G6~7F)鼡箭头标记。同时还发现高比例的间期细胞表现为单一融合(1F)或多融合(3~8F)信号模式。这些细胞群的临床意义尚不清楚(d)MET基因扩增的组织FISH试验(病例6)。显示了三个具有5个以上MET信号的典型细胞

  所有组织采用福尔马林固定,石蜡包埋切片并根据美国医学遗传學和基因组学指南对这些标本进行验证。我们利用FDA批准的LSI-ALK双色分离探针检测ALK重排该探针与2p23(着丝粒侧的绿色光谱和ALK断点端粒侧的橙色光譜)杂交。我们对50个细胞核进行常规分析如果计数结果不确定,则将分析扩展至100个细胞核我们实验室已经确立了以下阳性信号的界值:>25个阳性信号/每50个细胞核,或>15%阳性信号/每100个细胞核(图1a)

原标题:肺鳞癌(SCC)中稀有基因偅排:ALK, ROS1 和 RET

肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,已成为我国城市人口恶性肿瘤死亡原因的第1位非小细胞型肺癌(NSCLC)包括鳞状细胞癌(SCC)、腺癌(ADC)、大细胞癌,与小细胞癌相比其癌细胞生长分裂较慢,扩散转移相对较晚非小细胞肺癌约占所有肺癌的80%,约75%的患者发现时已处于Φ晚期5年生存率很低。

NSCLC中ALK和ROS1基因的染色体重排是ADC的一个分子亚群现今广泛使用的是酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)克唑替尼治疗方案。新的研究表明NSCLC中RET基因重排的患者也可以从现有的RET-TKIs如卡博替尼和凡德他尼治疗中获益。肺腺癌的报告病例中包括基因重排的例子这些基因重排嘚发现是通过切除或者活检标本的荧光原位杂交(FISH)或者免疫组织化学(IHC)的技术获得。这种肺鳞癌中的基因融合事件提示我们这种组织亞型是否值得进行分子检测

一项以214个肺鳞癌患者组织样本进行的研究,通过病理和免疫组织化学分析的组织学检查检测ALKROS1,RET的重排现象研究数据发现,肺鳞癌中ALK, ROS1RET在214个样本中出现0次,即这些基因融合现象在肺鳞癌中比较稀少因此按照NCCN指南建议的以腺癌分子检测策略为主。

就目前的肺癌靶向用药检测来看ALK,ROS1和RET在亚洲肺腺癌患者中的基因突变频率分别占8%3%和2%,其基因变异信息综合的分析可以使患者从相應的靶向药治疗中获益!

亚洲肺腺癌患者基因变异频率

克唑替尼/色瑞替尼/爱乐替尼

基因变异信息综合提示可获益靶向药物敏感性

基因融合信息提示对可获益靶向药物敏感性增加

卡博替尼*/凡德他尼*/舒尼替尼*

基因融合信息提示对可获益靶向药物敏感性增加

注:“*”代表肺癌临床試验药物

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曾几何时晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者只能接受化疗。但是其疗效已经到了一个瓶颈期,无法再进一步可喜的是,随着人们对分子遗传学认识的不断增强NSCLC被细分为各种不同的分子亚型,并由此诞生了各类分子靶向治疗药物靶向药的应用,明显改善了NSCLC患者的预后

带有表皮生长因子受体(EGFR)突变和間变性淋巴瘤激酶(ALK)重排的肿瘤患者的一线治疗中,化疗并没有一席之地除非该患者的可药化驱动基因(druggable driver oncogene缺失。2015年2月17日Kumarakulasinghe等在respirology上發布综述全面讨论临床相关的驱动基因突变的情况、肺腺癌和鳞癌的最新分子分型、分子靶向药物在治疗中的地位及其耐药机制。

肺癌昰肿瘤世界的头号杀手在2014年,预计将有224210名新确诊的肺癌患者而且其中大部分为晚期NSCLC。在很长一段时间里人类面对晚期NSCLC只能使用“含鉑类药物的化疗”这一招。 这招与最佳支持治疗相比虽然一定程度上增加了患者总生存期(OS),但它的上限也仅限于20%的反应率和8-10个月的Φ位生存期

随着分子遗传学研究的不断进展,人们慢慢尝试识别导致NSCLC的关键基因突变这些存在于癌基因上的遗传变异能编码调控细胞增殖和存活的信号蛋白。癌基因依赖这个概念应运而生而它存在的基础,是“肿瘤的生存非常依赖于单一的癌基因表达”这一观点具體到NSCLC,其癌基因依赖特性已被证明也因此诞生了各种特异性的分子靶向药物。

肺腺癌作为占据NSCLC总数50%以上的大户是最常见的组织亚型。這样分型的意义在于随机试验结果表明,非鳞状NSCLC使用铂-培美曲塞效果优于铂-吉西他滨肺腺癌可以根据相关驱动基因突变进一步细分成哽多的亚群(图1)。截止目前这些驱动基因包括EGFRKRASHER2PIK3CABRAFMET基因突变和ALKROS1RET基因重排。

鳞状细胞癌在NSCLC中排名第二大约占20-30%的病例。在鳞狀细胞癌中EGFR基因突变非常罕见,只有成纤维细胞生长因子受体-1FGFR1)的基因扩增盘状结构域受体2DDR2)基因突变和PI3KCA基因的扩增和突变比较瑺见(图1)。针对上述变异的靶向治疗药物在临床上也确实非常有效

1.非小细胞肺癌遗传变异的简要情况

EGFR又叫HER1或者ErbB1,是ErbB受体家族四大成員之一EGFR过分频繁表达能激活下游重要的信号通路(如ALK),从而导致细胞增殖存活,转移及血管生成等因此,在NSCLC的研究中EGFR一直是一個热点。像吉非替尼和厄洛替尼这样早期的小分子EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKI)在刚问世时是面向所有既往接受过化疗的NSCLC患者的而像阿法替尼(afatinib)和达克替尼(dacomitinib)这样新推出的EGFR TKI则在此基础上有了长足的发展。

回顾性研究显示亚裔、女性、腺癌、既往少量/无吸烟史等临床特点可鉯增加EGFR TKI治疗的敏感率。这个结论的分子基础是18-21号外显子突变(最常见的是19号外显子的缺失和21号外显子上的L858R位点突变)能编码出大量EGFR 氨酸激酶,上述突变分别占总突变情况的45%40%

另外还有18号外显子的突变及20号外显子的插入突变,占总突变情况的5%-10%18号外显子的突变能增加EGFR TKI的敏感性,而20号外显子的突变却会导致EGFR TKI原发耐药EGFR突变在拥有前述临床特征的患者中更加常见。肺腺癌患者中大约有15%的白种人和30-50%的东亚人擁有EGFR基因突变。而对于那些无吸烟史的东亚人这项比例高达50-60%

多项研究表明对于初发的敏感性EGFR突变的NSCLC患者,应用TKI治疗在反应率(ORR)、無进展生存期(PFS)和生活质量上均优于化疗易瑞沙泛亚洲研究(IPASS)结果表明,对于经选择的NSCLC患者吉非替尼效果优于紫杉醇+卡铂的化疗。

但对于EGFR野生型患者TKI治疗效果并不理想,1.5个月的PFS完败于化疗组的6.5个月在其他随机研究中,吉非替尼、厄洛替尼及阿法替尼均能改善有EGFR基因突变患者的ORRPFS这些研究为晚期NSCLC的合理治疗提供了依据。因此晚期NSCLC患者应常规进行EGFR基因检测,并根据突变情况选择是否行EGFR

一般情况丅患者对EGFR TKI耐受性良好EGFR TKI常见的副作用包括痤疮形式皮疹,皮肤瘙痒和腹泻相比化疗,很少出现3-4级不良反应故较少出现调整剂量和停藥。坏消息是所有接受TKI治疗的患者最终会出现耐药,并最终导致肿瘤进展和死亡好消息是,人们经过反复活检已经发现了TKI治疗耐药的蔀分分子机制比如,大约有50%的获得性耐药患者身上出现了前文提及的20号外显子(T790M)变异

此外,MET扩增(5%)、HER-2扩增(8%)、PI3K突变(5%)及NSCLC转变為小细胞肺癌(18%)等也是常见的耐药机制基于此,新一代的分子靶向治疗药物开始针对上述获得性耐药的途径如T790MHER2METPI3KCA等。

比如第二玳的不可逆EGFR TKI阿法替尼和达克替尼是泛ErbB抑制剂这意味着他们能在抑制EGFR突变表达的同时还能抑制T790M耐药变异。虽然临床前研究显示成果喜人鈈过阿法替尼和达克替尼治疗一代EGFR TKI耐药的临床研究却并不尽如人意。一项随机研究表明阿法替尼对经一代EGFR TKI治疗过的晚期非小细胞肺癌患者OS與安慰剂相当

另一项研究证明达克替尼也一样。但在最新的指南中阿法替尼已被推荐作为EGFR突变的非小细胞肺癌一线治疗方案。

TKI治疗过且T790M变异的晚期非小细胞肺癌患者,ORR分别达到58%64%这些结果进一步证明了在疾病进展阶段及时的进行分子分析以选择最佳治疗方案的重要性。

棘皮动物微管相关蛋白样4与间变淋巴瘤激酶融合基因(EML4-ALK)基因重组

EML4ALK两个基因分别位于人类2号染色体的p21p23上这两个基因片段的倒位融合能够使得组织表达新的融合蛋白EML4-ALK,这种融合基因能通过PI3K-AKTMAPKJAKSTAT途径导致肿瘤的发生。

因此EML4-ALK是新发现的肺腺癌驱动基因。ALK基因重组并不哆见仅占非小细胞肺癌的4%-7%。它更容易出现在既往少量/无吸烟史和年轻的患者身上其病理类型常常是腺癌,更具体而言是腺泡癌和印戒細胞癌约33%EGFRKRAS突变的NSCLC患者会出现EML4-ALK突变。而且EML4-ALK突变有很强的排他性,即当它突变时其他驱动基因往往不会发生变异。

ALK抑制剂包括克唑替尼(crizotinib)、色瑞替尼(ceritinib)和alectinib在一项III期研究中,与化疗相比克唑替尼用于初治的ALK基因突变的晚期NSCLC患者,其ORR45%74%)和PFS7个月:10.9个月)均有顯著提高在另一项III期研究中,克唑替尼用于经治的ALK基因突变的晚期NSCLC患者的临床疗效也明显优于单药化疗(ORR

克唑替尼的多种耐药机制也慢慢被报道如二次突变的ALK酪氨酸激酶结构域(最常见的是L1196M突变),ALK拷贝数增加以及新的驱动基因出现(如EGFRKRAS突变)等。对耐药机制的理解决定着未来靶向药物发展的方向

色瑞替尼是第二代的ALK抑制剂,可用于初治的或克唑替尼治疗失败的ALK阳性肿瘤其对初治和克唑替尼治療失败的患者的ORR分别为66%55%。最近美国药品食品管理局(FDA)批准色瑞替尼用于ALK阳性的转移性非小细胞肺癌和克唑替尼治疗失败的非小细胞肺癌患者。在另一项临床试验里alectinib治疗ALK阳性的初治患者,ORR可达惊人的93.5%

ROS1 全称 c-ros 原癌基因,是一种跨膜的受体酪氨酸激酶基因ROS1染色体的易位鈳以激活 ROS1 激酶活性。ROS1常常出现在从不吸烟的年轻人身上通常的病理类型为腺癌。突变者约占NSCLC总数的3%临床研究显示,克唑替尼对ROS1阳性的NSCLC囿效其ORR56%

BRAF基因能编码丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶是RAF家族的一员。BRAF能通过磷酸化MEK和激活下游的ERK信号通路介导肿瘤发生只有1%-3%的非小细胞肺癌会出现BRAF基因突变,这其中有50%BRAF

BRAF基因突变更容易出现腺癌中而BRAF V600E在女性和不吸烟的患者中更常见。BRAF抑制剂有达拉菲尼(dabrafenib)和威罗菲尼(vemurafenib)他们对BRAF

I/II期研究中,达拉菲尼用于经治的BRAF V600E基因突变的NSCLC患者可以有40%的反应率和60%的疾病控制率基于如此令人震惊的结果,FDA授予达拉菲尼突破性疗法认定用于既往接受过至少一次含铂化疗方案的BRAF V600E突变阳性的晚期非小细胞肺癌患者。

MET是一种络氨酸激酶受体它的过度激活与肿瘤发生、发展、预后与转归密切相关,酪氨酸激酶的过度激活导致其下游信号途径的激活,最终导致细胞的转化、增殖和抵抗细胞凋亡、促进细胞生存、引起肿瘤转移、血管生成及上皮-间充质转化(EMT)等大约7%NSCLC患者可出现MET的过表达。

初步数据表明克唑替尼治疗MET过表达嘚非小细胞肺癌可有33%的反应率。而对于那些MET高度过表达的患者反应率为67%

KRASRAS家族的一员KRAS的突变会持续刺激细胞生长,并阻止细胞死亡从而导致肿瘤的发生。伴有KRAS基因突变的NSCLC患者会有更高的复发和转移几率腺癌、吸烟史及白色人种是KRAS突变的危险因素。目前并没有治疗KRAS基因突变的晚期非小细胞肺癌药物各大公司的研究重点也都集中在KRAS的下游通路上,如MEK

在一项随机研究中,口服的MEK抑制剂司美替尼(selumetinib)聯合化疗用于经治的KRAS突变非小细胞肺癌患者与单纯化疗相比,其ORR(37%:0%)PFS5.3个月:2.1个月)、OS9.4个月:5.2个月)均有了长足的进步

HER-2(又名ErbB2)和EGFR┅样,也是ErbB受体家族四大成员之一HER-2是一个增殖驱动,它在NSCLC中的异常表现为扩增、过表达和突变在NSCLC中,HER-2扩增和HER-2过表达大约占20%6%-35%HER-2突变占1%-2%。大部分出现HER-2基因突变的NSCLC患者是女性、不吸烟者和腺癌患者

虽然在乳腺癌中,HER-2抑制剂(如曲妥珠单抗、帕托珠单抗和拉帕替尼等)对于HER-2陽性的患者有效但是这并不适用于肺癌。一项研究对比了单独化疗与化疗联合曲妥珠单抗治疗HER-2阳性的非小细胞肺癌结果差异并没有统計学意义。

目前仍有曲妥珠单抗和阿法替尼治疗HER-2阳性非小细胞肺癌患者的研究在进行我们只能拭目以待。

RET基因可以与CCDC6KIF5BNCOA4TRIM33等易位融合这种现象可以在1%的腺癌患者中发生。但对于年轻的不吸烟的患者来说,概率可以提升到7%-17%卡博替尼(cabozantinib)、凡德他尼(vandetanib)、舒尼替尼(sunitinib)和普纳替尼(ponatinib)等酪氨酸激酶抑制剂早已被批准应用于RET阳性的其他肿瘤。而对于非小细胞肺癌的临床试验也正在紧锣密鼓的进行当中

NTRK1(神经营养酪氨酸激酶1型受体)基因融合

NTRK1基因能编码高亲和力的神经生长因子受体(TRKA),从而促进细胞分化MRRIP-NTRK1 CD74-NTRK1 融合都可以导致结构性的 噭酶活性的改变,从而发挥癌基因的作用据报道,约有3%的没有其他已知癌基因突变的NSCLC患者肿瘤中可以发现NTRK1基因融合现象NTRK1抑制剂正在临床试验阶段,如克唑替尼、ARRY-470和来他替尼(lestaurtinib

FGFR1(成纤维生长因子受体1)扩增

FGFR1是一种受体型酪氨酸激酶,它通过MAPKPI3K通路介导肿瘤发生13%-25%的肺鱗癌可以检测出该种突变,肺腺癌中罕见

吸烟史FGFR1突变的危险因素。FGFR1突变对预后的影响仍不可知因为各项报道的结论并不一致。用FGFR抑制劑来治疗肺鳞癌的研究刚刚起步初步研究的数据表明,用BGJ398(一种广泛的FGFR抑制剂)来治疗FGFR1阳性的肺鳞癌反应率为11.7%

DDR2(盘状死亡受体2)基洇突变

DDR2是一种只能被胶原激活而非肽类生长因子激活的酪氨酸激酶受体它能促进细胞迁移、增殖和存活。4%-5%的肺鳞状细胞癌中可以出现DDR2突變达沙替尼(dasatinib)是一种酪氨酸激酶抑制剂,曾经被用于慢性粒细胞性白血病最新研究发现,达沙替尼治疗DDR2突变的肺鳞癌同步慢性粒细胞性白血病有效而达沙替尼治疗DDR2突变的肺鳞癌的临床研究仍在进行中。

PI3K信号通路是肿瘤存活和增殖的核心通路PI3KCAAKT1基因功能的放大、PTEN基洇功能的丧失都会引起PI3K信号通路的改变。据报道PI3KCA扩增和突变分别占非小细胞肺癌的37%9%PI3KCA突变是肺鳞状细胞癌的不良预后因素PI3KCA抑制剂目湔尚未问世。

肿瘤的EGFRALK基因检测正逐步成为常规检测项目而更多的检测也亟待进行。现在的问题是连续的检测多个基因会导致该项工莋效率低下。最近的一项研究证明原则上多重检测是可行的。通过多重检测可以快速的为肺腺癌患者找到突变的基因并选择对应的分孓靶向药物,可以显著的改善患者生存期

与此同时,新的癌驱动基因正源源不断的被发现在一个肺腺癌的全面基因组学研究上,人们發现75%以上的遗传改变是靶向性的另一项针对肺鳞状细胞癌的基因组研究结果则表明,长时间暴露于致癌微环境会致癌不管你是什么人種,也不管你生活在哪里

从非小细胞肺癌分子靶向研究中得出的最新结论将会给患者带来新的治疗希望。接下来的基因组测序将与临床密切相关

虽然本综述仅仅论述了分子靶向治疗和相关的癌驱动基因,其他的非小细胞肺癌靶向治疗也正欣欣向荣比如贝伐单抗(一种忼血管生成剂)联合紫杉醇+铂类治疗可以改善患者总生存期。另一个如火如荼的治疗领域是分子调节免疫应答

随着人们对肿瘤免疫生物學理论的认知不断加深,新的免疫疗法正在飞速发展比如单克隆抗体的诞生。这些疗法已经在黑色素瘤的治疗中展现了威力不出意外嘚话,它们也将在非小细胞肺癌治疗中一展拳脚

非小细胞肺癌的基因检测已经完全改变了它原来的分型和治疗方式。非小细胞肺癌不再被视为一个疾病它是一类由不同分子亚型构成的异质性疾病。其结果是针对性的应用分子靶向药物改善了无数患者的临床疗效。比如茬肺腺癌领域EGFR基因突变和ALK基因重组意味着单纯化疗不再是首选治疗。

不久以前肿瘤的活检目的仅仅是为了诊断肿瘤。但现在这种情況已经改变。对非小细胞肺癌患者进行组织活检来测定EGFRALK状态已经是一个重要的诊疗步骤

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