现在16sDNA测序多少钱一个样?

rDNA序列包含10个保守区域和9个可变区域,保守区在细菌间差异不大,可变区具有属或种的特异性。对环境样品(如土壤、水源、皮肤、肠道等)的微生物V4可变区进行测序分析,可获得物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化、群落比较等信息,在环境中微生物组成及进化、微生态研究中有重要指导作用。
康测科技研发的KC-Digital-16S rDNA测序产品,可在扩增前对样品中的每一个微生物V4区域添加唯一的UMI标签,在扩增、测序后对数字标签进行计数,可以完全去除PCR扩增的偏好性,实现数字化精确定量。同时还可准确过滤扩增、测序过程产生的错误,大大提高OTU分类的分辨率,实现对细菌株系进行鉴定。有助于对细菌突变频率、菌群组成的变化机制等进行深入研究。

常规16s rDNA测序与康测 digital 16s rDNA测序建库原理图和文库结构图。KC-digital 16s rDNA 测序扩增引物中包含高复杂度的数字标签(UMI),用以区分不同的模板,并跟踪同一模板扩增出的所有分子。

不同DNA分子带有不同的UMI,同一DNA扩增出的所有分子带有相同的UMI。
(1)基于UMI可以消除扩增、测序引入的假阳性重复,还原真实的菌群结构;
(2)基于UMI可对同一模板的扩增Reads进行align,消除扩增测序引入的突变;

康测UID-16S rDNA测序相较于普通16S rDNA测序能够鉴定更多的物种:

(2)UMI实现准确纠错和精确定量,精确还原物种丰度和菌群结构;
(3)UMI去除扩增对结果的影响,大大提高微生物含量低的样品检测准确性;
(4)提高OTU分类阈值,达到种属、甚至株系的高分辨率;

医学领域:常见疾病与人体微生物的关系;

动物领域:肠道、瘤胃(如产甲烷菌类群)与动物健康/营养消化研究等;

农业领域:根据微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等;

环境领域:雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境等;

特殊极端环境:极端环境条件下的微生物类群研究。

>不同菌等量混合之后, 检测结果菌间含量差异很大;
>同一菌株混合含量梯度增加, 检测结果无规律;
普通1 6s rDNA测序研究菌群结构尚可,但跟踪特定菌群含量变化结果非常不准确。

Nature Letter使用UMI对DNA进行标记,用 以去除PCR和测序过程中引入的假阳性突变。对 rpoB基因含有特定突变的菌进行梯度稀释,然后使用该方法对不同稀释度样品中该突变的含量进行检测,发现:
>检出量与加入量呈现很好的线性关系;
上述结果表明,UMI 可以消除序列假阳性变异,并大大提高菌群定量的准确性。

绝对定量16S rDNA-seq信息由武汉康测科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于绝对定量16S rDNA-seq报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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