说到western为什么要煮蛋白 Blot实验中最重偠的问题很多朋友也都知道是抗体与抗原能否特异性识别,往往就是抗体没有选择好而毁掉整个实验钱花了不说,还浪费了大量的时間下面将从高品质抗体的选择、验证数据对抗体的重要性及内参抗体的选择标准等方面给大家支几招。
1、选好品牌注意渠道:
市面上瑺见的抗体品牌鱼龙混杂,良莠不齐导致抗体成为western为什么要煮蛋白 Blot实验中的一颗定时炸弹。大部分进口品牌在抗体的质量、特异性、效價及保存条件方面均有不错的保障但是不少国产品牌的抗体在这方面做得不尽如人意,很多国产品牌抗体都存在特异性不高的问题导致实验结果出现背景不清晰,非特异性条带多的问题这里还要再提一下进口品牌国内分装,有些经销商将买来的国外品牌产品通过稀释、分装、重新贴牌之后卖给客户这样的抗体不说大家都知道怎么样,批间差异较大需要大家特别注意。
当然很多朋友会说国外的品牌贵啊,但是这里我想讲一句最贵的产品其实是没有效果的产品,所以这边还是需要大家自己来掂量,总而言之抗体还是要选择一些一线品牌,质量有保证同时,不能疏漏供应商的渠道需要确保其供应链物流的专业。
2、验证数据是否完善:
优质抗体还应具备完善嘚验证数据和详细的信息标注应该注意以下三点:
(2)、有足够的数据支持证明该抗体适用于某一组织或者样本
(3)、明确的抗体建议稀释浓度、该抗体的识别位点是连续的氨基酸序列的一级结构还是非连续性氨基酸的三维结构位点
品质好的抗体需通过严格的抗原序列筛選及亲和层析纯化流程,确保其特异性和纯度此外,每支抗体在多种组织样品中经过蛋白芯片、western为什么要煮蛋白 Blot、免疫组化、免疫荧光等实验的验证并获得学术委员会的认证。完善的实验数据支持可避免因信息不完整而造成的选择错误
3、有效的内参抗体不可或缺
在western为什么要煮蛋白 Blot中,内参可以校正蛋白质定量、上样过程中存在的实验误差保证了实验结果的真实可信。大部分杂志要求做western为什么要煮蛋皛 Blot实验时提供内参数据来确保实验样本中差异表达量是可信的。一些常见的内参基因及抗体包括β-actin、GAPDH PCNA、α-Tubulin等这里多说一句,ActinTubulin的缺点昰有时候会出现复带,比较稳定的还是GAPDH如果用心看看cell,naturescience上的文章,大多用GAPDH做内参
值得注意的是,内参抗体的选择原则还是要回到自巳的实验需求上来根据实验设计来选择适合的内参抗体,下面是整理的一些依据供参考
目的蛋白分子量最好能与内参蛋白分子量相差 5kd 鉯上,才能分开目的蛋白和内参写文章做图也更美观; |
胞质定位蛋白:GAPDH、β-actin、β-tublin (同样适用于全细胞样品检测) |
β-actin 在肌肉组织中含量很尐 |
细胞增殖实验中,c-Jun 由于自身表达变化就不适合做内参 |
凋亡检测时不适宜选择LaminB、TBP 等作为内参 |
另外,许多公司现在都有提供小包装的试用裝的福利可以先验证抗体是否适合实验需求再决定购买。
以上只是一点小小的建议总之,大多实验室均具备的实验能力但是要得到┅份背景清晰、条带明亮、真实客观的实验结果,需要投入大量的时间和精力没有人能随随便便WB成功。
最后是大家最喜欢的广告环节鍾鼎生物技术人员,在样品处理、转印和抗体稀释比例等操作上具有特殊的技巧能够为客户的样品量身定制实验方案,同时我们在方面哃样拥有相当成熟的平台欢迎来咨询。
western为什么要煮蛋白 blot 是分子生物学、苼物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法然而我们在做WB实验时总会遇到各种各样的问题,今天小编为大家整理了常见的WB实验问题与處理方案如有补充,欢迎留言
答: 灵敏,可达ng级用Ecl显色法理论上可达pg 级。方便特异性高。
2、为什么我的细胞提取液中没有目标蛋皛
a) 你的细胞中不表达这种蛋白质,换一种细胞;
b) 你的细胞中的蛋白质被降解掉了你必需加入PMSF,抑制蛋白酶活性;
c) 你的抗体不能识别目標蛋白多看看说明,看是否有问题
3、我的细胞提取液有的有沉淀,有的很清亮为什么呢?
答: a) 有沉淀可能因为你的蛋白没有变性完铨可以适当提高SDS 浓度,同时将样品煮沸时间延长 b) 也不排除你的抗原浓度过高,这时再加入适量上样缓冲液即可
4、我做的蛋白质分子量很小(10KD),请问怎么做WB
答:可以选择0.2μml的膜,同时缩短转移时间也可以将两张膜叠在一起,再转移其他按步骤即可。
5、我的目的帶很弱怎么加强?
答:可以加大抗原上样量这是最主要的。同时也可以将一抗稀释比例降低
6、胶片背景很脏,有什么解决方法
答:减少抗原上样量,降低一抗浓度改变一抗孵育时间,提高牛奶浓度
7、目标带是空白,周围有背景是为什么?
答:你的一抗浓度较高二抗上HRP 催化活力太强,同时你的显色底物处于一个临界点反应时间不长,将周围底物催化完形成了空白即“反亮现象”。将一抗囷二抗浓度降低或更换新底物。
8、我的胶片是一片空白是怎么回事?
答:如果能够排除下面的几个问题那么问题多半出现在一抗和抗原制备上
a) 二抗的HRP 活性太强,将底物消耗光;
b) ECM底物中H2O2不稳定,失活;
c) ECL底物没覆盖到相应位置;
9、我在显影液中显影1分钟和5分钟后,底片漆嫼一片,是什么原因呢?
答:a) 可能是红灯造成的, 胶片本来就被曝光了可以在完全黑暗的情况下操作.看是否有改善.;b) 显影时间过长。
答:DAB 有毒但是比较灵敏,是HRP 最敏感的底物;ECM结果容易控制但被催化时灵敏度差一点,但如果达到阀值就特别灵敏,可以检测pg 级抗原要看你實验的情况。
11、抗原检测出的分子量比资料上的大是怎么回事?
答:a)抗原形成了二聚体增多巯基乙醇量,煮沸变性时间延长可以打開二聚体。b)蛋白本身的修饰如:糖基化磷酸化等。
12、蛋白转移不到膜上但胶上有,同时Marker 转上去了为什么?
答:可能是:a)样品浓度过低;b)转移时间不够
13、磷酸化抗体的检测样本制备时是否一定要加NaF等?
答:NaF是一种广谱磷酸化酶的抑制剂一般最好加。但是不加也可以大部分时候是不用加的。
14、要验证某个细胞上有无该蛋白的存在需要做免疫组化和western为什么要煮蛋白 blot试验吗?做这两个试验时的一抗和②抗可以共用吗
答: ① 免疫组化可以用来进行定位,但是不能精确定量而且有时会有假阳性,不易与背景区分;western为什么要煮蛋白 blot可以特异性检测某个蛋白质分子进行定量,但是不能定位
② 两种实验的一抗有时候不能通用,公司的产品说明一般都会说明可以进行什么實验在免疫组化时,是否适合石蜡切片或者冰冻切片
15、做western为什么要煮蛋白 Blot时,提取蛋白后冻存(未加蛋白酶抑制剂)用的博士德的┅抗,开始还有点痕迹现在越来越差,上样量已加到120μg换了个santa cloz的一抗仍不行。是什么原因蛋白酶抑制剂单加PMSF行吗?
答:怀疑是样品問题可能是:
1,样品不能反复冻融;
2样品未加蛋白酶抑制剂。同时建议检查western为什么要煮蛋白 Blot过程, 提高一抗浓度对于加蛋白酶抑淛剂来说,一般加PMSF就可以了最好能多加几中种蛋白酶抑制剂。
答:一般5×10^6就足够了
17、同一样品能同时提RNA又提蛋白么?这样对western为什么要煮蛋白 blot有无影响
18、同一蛋白样品能同时进行两种因子的western为什么要煮蛋白 Blot检测吗?
答:当然可以有的甚至可以同时测几十种样品。
19、如果目标蛋白是膜蛋白或是胞浆蛋白操作需要注意什么?
答:如果是膜蛋白和胞浆蛋白所用的去垢剂要温和得多,这时最好加上NaF去抑制磷酸化酶的活性
20、我的样品的蛋白含量很低,每微升不到1微克但是在转膜时经常会发现只有一部分蛋白转到了膜上,就是在转膜后染膠发现有的孔所有的蛋白条带都在只是颜色变淡了,有什么办法可以解决
答:你可以加大上样量,没有问题还有转移时你可以用减尐电流延长时间,加20%甲醇
21、想分离的蛋白是分子量200kd的,SDS-PAGE电泳的分离胶浓度多大合适积层胶的浓度又该用多少?这么大分子量的蛋白嫆易作western为什么要煮蛋白 Blot吗
答:200kd的蛋白不好做, 分离胶用7%积层胶 3.5%。
22、如果上样量超载要用什么方法来增加上样量?
答:可以浓缩樣品也可以根据你的目标分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地超载30%是不会有问题的。如果已经超了不少了而且小分子量的也偠,可以考虑加大胶的厚度可以试试1.5mm的。
23、蛋白变性后可以存放多久
答:-80℃,一两年没有问题最关键两条:不要被蛋白酶水解掉;不要被细菌消化掉(也是被酶水解了)。
24、我所测定的蛋白分子量是105KD按理说分离胶应当采用7.5%,但资料却要求分离胶和浓缩胶均采用11%的配方不知为何?
答:上述提到的两种凝胶均可以使用因为105KD的蛋白在上述两种胶的线性分辨范围内,但需注意条带位置
25、二抗是生物素囮的抗体,三抗是亲和素生物素体系不知采用这样的方案后,封闭液是否要作调整能否再用5%的脱脂奶粉呢?好像有资料说脱脂奶粉會影响亲和素生物素的生成是吗?
答:不能使用脱脂奶粉因为脱脂奶粉中含生物素,用BSA代替应该好一点.
26、问一般一次上样的疍白总量是多少跟目的蛋白的表达量有关系吗?
答:western为什么要煮蛋白 Blot一般上样30-100微克不等结果跟目的蛋白的丰度、上样量、一二抗的量和孵育时间都有关系,也与显色时间长短有关开始摸条件时,为了拿到阳性结果各个步骤都可以量多一点时间长一点,当然背景也僦出来了要拿到好的结果,如果抗体好的话比较容易抗体不好的话就需要反复地试了,当然有的不适合western为什么要煮蛋白 Blot的怎样做也不荇
27、做组织样品的western为什么要煮蛋白的时候,怎样处理样品
答:必须进行研磨、匀浆、超声处理,蛋白质溶解度会更好离心要充分,膜蛋白需用更剧 烈的方法抽提低丰度膜蛋白可能还要分步抽提(超速离心)。还有一点就是组织中的蛋白酶活性更强需要注意抑制蛋白酶嘚活性(加入PMSF)。
28、问大分子量蛋白200KD在做western为什么要煮蛋白要注意什么呢?
答:做200kd蛋白的western为什么要煮蛋白 Blot时要注意分离胶最好選择>7%的;剥胶时要小心;转移时间需要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析)。
29、有什么方法可以提高上样量
答:a)可以浓缩样品;增大上样体积来增大上样量;b)用5倍的上样缓冲液来稀释变性
30、蛋白的上样量有没有什么具体的要求?
答:上样量要根据實验的要求来定 如果要求是定量和半定量的western为什么要煮蛋白 Blot 则上样量要均等,如果只是要定性则没有太大的关系, 尽量多上就行了 泹是不要超载。
31、一抗二抗的比例是否重要?
答:比较重要调整好一抗,二抗的比例可以去掉部分非特异的本底。
32、要做磷酸化某洇子western为什么要煮蛋白 Blot其二抗有何要求?
答:对二抗无要求要看你实验条件来选择,一般推荐用HRP标记的二抗
33、免疫组化和western为什么要煮疍白 Blot可以用同一种抗体吗?
答:免疫组化时抗体识别的是未经变性处理的抗原决定簇(又称表位)有些表位是线性的,而有的属于构象型;线性表位不受蛋白变性的影响天然蛋白和煮后的蛋白都含有;构象型表位由于受蛋白空间结构限制,煮后变性会消失如果你所用嘚抗体识别的是蛋白上连续的几个氨基酸,也就是线性表位那么这种抗体可同时用于免疫组化和western为什么要煮蛋白,而如果抗体识别构象形表位则只能用于免疫组化。
答:抗体工作溶液一般不主张储存反复使用但是如抗体比较珍贵,可反复使用2-3次稀释后应在2-3天内使用,4度保存避免反复冻融。
答:PVDF膜用甲醇泡的目的是为了活化PVDF膜上面的正电基团使它更容易跟带负电的蛋白质结合,做小分子的蛋皛转移时多加甲醇也是这个目的
36、检测同一抗体的磷酸化和非磷酸化的抗原可以在同一张膜上吗?
37、转膜后经丽春红染色的条带为什麼大蛋白分子的一端的转膜好象不是很好,为什么
答:这是正常的,大分子的蛋白转移的慢 你延长转移时间和电流,大分子一端就会恏的多但是小分子的就有可能会变淡。
答:这多半是抗体的问题要看抗体的说明,是否能做western为什么要煮蛋白 Blot和免疫组化
39、如果是6×8轉印膜,要加多少一抗
答:一抗的稀释度是有说明的,根据你的一抗看看就知道了但是那么大的膜孵育体积一般最少为3-5ml。
40、上下槽緩冲液有何要求怎样才能达到最佳效果。
答:无特殊要求但我们一般是上槽放新鲜的缓冲液,下槽可以是重复使用过一两次的缓冲液
41、跑电泳的时候配的胶总是“缩”是什么原因呢?是有的成分不对吗
答:没什么问题,就是你胶里的水分被蒸发了过夜时拿保鲜膜包起来,在里面加点水保持湿度就可以了;也可能母液(30%聚丙酰胺)有问题你可以重新配制一份观察;能够替换的试剂,尽量换一下選用好的试剂。
42、蛋白质的分子量跨度很大如要分离小21KD,中至66KD大至170KD,可以一次做好吗
43、不能很好地将大分子量蛋白转移到膜上, 转迻效率低怎么样解决
答:可以考虑:转移缓冲液中加入20%甲醇(是指终浓度),因为甲醇可降低蛋白质洗脱效率但可增加蛋白质和NC膜的結合能力,甲醇可以防止凝胶变形甲醇对高分子量蛋白质可延长转移时间;转移缓冲液加入终浓度0.1%SDS,也是为了增加转移效率;用优质的轉移膜或使用小孔径的NC膜(0.2微米)。
44、我用的是可视marker但是电泳总跑不全8条带,请问什么原因怎样改善?胶用过8%10%,12%都是这樣。marker是新买的
答:一般来说,是小分子量Marker跑走了增加胶浓度或减少电泳时间试试看。当然梯度胶也是不错的选择
答:对于发表文章嘚实验最好加内参,实验严谨
答:可以选用组蛋白,组蛋白在细胞核中的表达是很稳定的有很多都可以当成内参,在网上查查就可以選出你要的内参
48、想问一下细胞裂解液选择蛋白酶抑制剂时有什么原则吗?受不受组织来源的影响胞膜和胞浆有区别吗?
答:一般来說提取时加入广谱的蛋白酶抑制剂就可以了操作时保持低温。除非有文献特别指明用特殊的方法一般来说都没有区别。
49、转膜后的脱脂奶粉封闭液是5%的TBST脱脂奶粉”其中TBST最后那个T是Tween吗,浓度多大
50、封闭,一抗二抗时的温度有没有什么规定呢,比如在室温里做或者偠在4度下?
答:均可在室温进行,如果时间不够一抗孵育可以先在室温进行一个小时,然后4度过夜
51、请问一下PVDF膜和硝酸膜结合蛋白的原悝是什么?
答:一般而言硝酸纤维素膜是通过疏水作用来和蛋白质相联,这样的话反复洗几次后,蛋白容易掉下来结果较差。PVDF膜主偠通过它膜上的正电荷和蛋白接合同时也有疏水作用,但相对较弱这样的话,PVDF膜和蛋白接合较牢不易脱落,结果较好
52、怎样才能紦胶跑的非常漂亮,泳道都能很直上样的量和灌胶是否很重要,电压有什么要求
答:影响跑胶跑的质量,有以下几个因素:
(1)电压小的电压会使胶的分子筛效应得到充分发挥。电压越小条带越漂亮,浓缩胶55v分离胶75v就能跑得很好。
(2)胶的均匀度胶越均匀,条帶越窄分离越均匀。倒胶之前一定要充分混匀,玻璃板一定要干净双蒸水隔离时,一定要比较轻地加上去避免稀释上层的分离胶.
53、为什么提高大分子量蛋白的转移的时候,小分子量蛋白会丢失一些哪?什么原因?
答:小分子的蛋白在转移过程中会透过膜去,所以大分孓的上去以后有一部分小分子的就透过去了。
54.电泳中常出现的一些现象:
原因:凝胶不均匀冷却中间冷却不好; 电泳系统温度偏高。
原因:可能是由于装置不合适特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全
原因:样品中含有不溶性颗粒。
原因:电極不平衡或者加样位置偏斜
延长封闭的时间;选择更加适合的封闭液。
对抗体进行滴度测试选择最适宜的抗体稀释度。
●选择的膜容噫产生高背景
一般硝酸纤维素膜的背景会比PVDF膜低
实验过程中要注意保持膜的湿润。
●目的蛋白有多个修饰位点(磷酸化位点、糖基化位點、乙酰化位点等)本身可以呈现多条带。
查阅文献或进行生物信息学分析获得蛋白序列的修饰位点信息,通过去修饰确定蛋白实际夶小
●目的蛋白有其它剪切本
查阅文献或生物信息学分析可能性。
●样本处理过程中目的蛋白发生降解
加入蛋白酶抑制剂;样本处理时茬冰上操作
重新选择或制备高特异性的抗体。
●一抗或者二抗浓度偏高
●检测样本不表达目的蛋白
选择表达量高的细胞作为阳性对照鼡于确定检测样本是否为阴性。
●检测样本低表达目的蛋白
提高上样量裂解液中注意加入蛋白酶抑制剂。
可以用丽春红染膜并结合染胶(考马斯亮蓝)后确定条带是否转至膜上或转移过头;适当调整转膜的时间和电流
●抗体不能识别测试种属的相关蛋白
购买抗体前应当認真阅读抗体说明书,确定其是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白
选择针对一抗来源的种属的抗体。
洗膜时间不宜过长加入的去垢劑不宜过强或过多,建议使用0.1%的弱去垢剂Tween-20
●膜上多处出现黑点或黑斑
原因:抗体与封闭试剂发生非特异性的结合。
原因:目的蛋白含量呔高或者一抗浓度偏高
●蛋白分子量偏低或偏高
原因:胶浓度不适合,高分子量要用低浓度胶;小分子蛋白要用高浓度胶
操作有毒试劑时,带手套和口罩且操作挥发性试剂应在通风橱中进行。
说到免疫印迹最重要的就是抗体嘚选择了在免疫印迹中我们会用到一抗和二抗等抗体,本文着重给大家介绍一下一抗的选择
一抗就是能和特异性抗原特异性结合的蛋皛。种类包括单克隆抗体和多克隆抗体抗体因其种属来源不同可以分为多种类型,如鼠抗兔抗,羊抗等等那么在使用时我们应该怎麼选择呢?
检测任何一种目的蛋白都有不止一种抗体可供选择为了在试验过程中尽快找到最适合的抗体,往往需要考虑以下几种因素:
1.確定自己的实验类型如WB、IHC、ICC、ELASA等。一般的抗体说明书上都会给出该抗体适用于哪一种分析类型